论著 | 靶向高通量测序鉴定非结核分枝杆菌菌种的应用价值

文章来源：中国防痨杂志，2023，45 (4):  362-366.

doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20220530.

基金项目：广东省医学科学技术研究基金（C2021090）

作者：陈华，陈品儒，李艳阳，邓政先，许柳清，梁锋，胡锦兴

作者单位：广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心/呼吸疾病国家重点实验室，广州 510095

通信作者: 陈品儒，Email：chenpinru1965@126.com

摘 要

目的：探讨靶向高通量测序 (targeted next-generation sequencing, tNGS) 技术在非结核分枝杆菌菌种鉴定的应用价值。

方法：收集2021年7月至2022年9月，在广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心住院患者的428份标本进行研究，其中，痰标本312份，支气管肺泡灌洗液标本116份。对上述标本进行tNGS分枝杆菌鉴定 (简称“tNGS法”) 和微生物培养 (BACTEC MGIT 960) +DNA微阵列芯片法 (简称“培养法”) 进行分枝杆菌菌种鉴定，并对2种方法检测结果进行比较。

结果：（1）tNGS法和培养法分别分离出结核分枝杆菌102份和56份，非结核分枝杆菌150份和182份。（2）tNGS法的分枝杆菌检出率为58.88% (252/428)，与培养法阳性率[55.61% (238/428)]比较，差异无统计学意义(χ²=0.936，P=0.333)。（3）以培养法为参照标准，tNGS法检测分枝杆菌的敏感度、特异度、假阴性率、假阳性率、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为80.65% (200/248)、92.22% (166/180)、22.43% (48/214)、6.54% (14/214)、93.46% (200/214)、77.57%(166/214)和0.710。

结论： tNGS法与培养法一致性良好，具备很好的时效性、敏感度、特异度，利于早期制定临床治疗方案。

关键词： 分子序列数据；分枝杆菌属；诊断，鉴别

本文来自于“中国防痨杂志期刊社”公众号、中国防痨杂志（www.zgflzz.cn）