请问大家,在提取软骨组织 RNA 时必须要加乙醚吗?有没有什么替代试剂?
Q:请问大家,在提取软骨组织 RNA 时必须要加乙醚吗?有没有什么替代试剂?谢谢。
A1:可以用氯仿代替乙醚,可以起到一样的效果
Q:小鼠下丘脑 RNA 提取可以做吗?
A1:可以的。下丘脑是大脑的一部分,其中包含许多重要的神经元和神经递质,因此从小鼠下丘脑中提取 RNA 可以用于分析基因表达和信号通路的研究。
RNA 提取的方法可以根据实验室的具体需求而定,例如使用商业 RNA 提取试剂盒或自制试剂盒,根据实验室的设备和技术水平选择合适的方法。需要注意的是,在取样、提取和储存 RNA 过程中,应避免 RNA 降解和污染,以保证实验的准确性和可靠性。
A2:小鼠下丘脑 RNA 可以用 Trizol 法进行提取。
Q:真菌,特别是食药用菌,除了 ITS 基因,还可以用什么鉴定呢
A1:真菌检查的方法包括直接镜检、真菌培养、血清学试验、组织病理检查等,最常用的就是真菌的直接镜检。真菌的直接镜检需要使用酒精清洁创面,可以收取表面的皮屑、毛发、甲板或者体液组织等。将收取的标本放在玻璃片上,加 5%-10% 的氢氧化钾液,盖上盖玻片,溶解一会儿,一般 5 分钟后可以在显微镜下低倍镜下寻找有无菌丝或者孢子,寻找到菌丝或者孢子后可以转为高倍镜进行观察。其他还有通过筛子检验,比重检验法,染色检验法,洗涤检验法,保湿萌芽检验等。
A2:鉴定真菌的方法还包括以下几种:
核糖体 RNA 基因序列分析:核糖体 RNA 基因序列是真菌基因组中高度保守的部分,不同真菌种类之间这些基因序列有显著差异,通过比对真菌样品的核糖体 RNA 基因序列和数据库中的已知真菌的核糖体 RNA 基因序列,可以确定真菌种类。
形态学特征:真菌在形态学特征上具有较大的多样性,通过观察真菌的孢子、菌丝、菌落等形态学特征,可以初步确定真菌种类。
生理生化特性:真菌在生理生化特性上也有差异,通过观察真菌的生长条件、代谢产物等生理生化特性,可以进一步确定真菌种类。
这些方法通常可以结合使用,以提高真菌鉴定的准确性。
A3:酵母的话,是可以做菌落 PCR,跟细菌相似.如果是丝状真菌的话,建议还是提一下 DNA 吧.真菌鉴定目前常用的 ITS 序列,如果是单菌的 DNA 的话,可以参考基因测序
Q:请教 trizol 法提取外泌体 RNA 该如何弄。
A1:以下是 Trizol 法提取外泌体 RNA 的步骤:
收集外泌体:用离心或超声波等方法收集培养基或生理液中的外泌体。建议在收集前,预先处理样品,如去除细胞残留物、碎片等。
加入Trizol:向外泌体悬液中加入 Trizol 试剂,建议加入试剂体积是悬液体积的 10% 到 20%。轻轻摇晃管子使 Trizol 均匀分散。
加入氯仿:加入氯仿等有机溶剂,摇晃离心管混合均匀。离心管在室温下放置5-10分钟,让混合物充分分层。
分离上清:用移液器取出上清液转移到新的离心管中。避免取到下层白色物质。
沉淀RNA:向上清液中加入异丙醇等制备缓冲液,使 RNA 沉淀。使试管上下翻滚混合。
洗涤沉淀:用酒精洗涤沉淀,再用 RNase-free 的乙醚洗涤沉淀,以除去氯仿等有机溶剂。
重悬RNA:向沉淀中加入 RNase-free 的水重悬 RNA。
质检RNA:通过 Nanodrop 或者 Agilent Bioanalyzer 等仪器检测 RNA 质量和浓度。
需要注意的是,在 Trizol 提取过程中,外泌体可能会受到损伤或者破裂,因此提取的 RNA 有可能来自于外泌体本身以及外泌体释放的 RNA,所以需要仔细处理样品,以确保提取的 RNA 来自于外泌体。
Q:质粒电转到毕赤酵母感受态后,涂板,长出菌后,做菌落 pcr 怎么做
A1:可以尝试用快速菌落 PCR 的方法来提取和扩增酵母菌的质粒 DNA。具体步骤如下:
用菌落 PCR 提取酵母菌的质粒 DNA,具体步骤如下:
选取酵母菌菌落,用无菌的 PCR 管刮下一小块菌落。
加入10-20 μL TE缓冲液(pH8.0)或蒸馏水,用微量吸管或者细管破碎菌落。
加入 1 μL 蛋白酶K,37℃ 孵育 5-10 分钟。注意不要过度消化。
将管子放入 100℃ 的水浴中,热搅拌 10 分钟使细胞裂解,然后放到冰上冷却 1-2 分钟。
离心 3-5 分钟,收集上清液。
用上清液作为 PCR 反应的 DNA 模板,进行 PCR 扩增。
菌落 PCR 反应条件:
模板:上述提取的上清液
引物浓度:0.5 μM
Taq聚合酶浓度:2.5 U/25 μL
反应体系:10× Taq缓冲液、2.5 mM dNTPs、MgCl2、模板、引物和Taq聚合酶
反应体积:25 μL
PCR 程序:95℃ 预变性 5 分钟,35-40 个循环(95℃ 变性 30秒、55℃ 退火 30 秒、72℃ 延伸 1-2 分钟),72℃ 最后延伸 10 分钟。
扩增产物可以进行琼脂糖凝胶电泳检测,如果有特异性条带,则可用提取基因的方法纯化扩增产物进行测序。
需要注意的是,这种方法提取的 DNA 纯度和质量可能不如商用试剂盒提取的好,因此需要进行 PCR 反应前进行一定程度的质检。此外,使用不同菌株的时候,有些酵母菌可能需要更长的 PCR 扩增时间才能够扩增出特异性产物,需要根据实验情况进行调整。
最后编辑于 2023-03-28 · 浏览 872