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linux系统lftp上传原始数据至GEO数据库

口腔内科学医学生 · 最后编辑于 2022-10-09 · IP 四川四川
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这个帖子发布于 2 年零 293 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

如何利用linux系统上传原始数据至GEO数据库?

网上有很多帖子将如何获得GEO账号,准备数据,这里我们只讲如何利用linux系统lftp上传数据。

1.在GEO数据库中获得上传的文库号后,打开example Linux/Unix sessions,这里就会出现示例代码

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2.在你准备好数据的文件下打开终端,输入“pwd”,这时显示出你所在文件夹的绝对路径,留着后续用;

3.在终端输入示例代码的第一句:lftp ftp://geoftp:XXX/XX.ncbi.nlm.nih.gov

4.在终端输入示例代码的第二句:cd uploads/XXX

5.在终端输入示例代码的第三句:mirror -R 文件所在的绝对路径

这时 -R不能省略,绝对路径可以复制上面我们显示的路径即可

然后就是漫长的等待啦

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