做MLST，但扩不出目的条带

各位前辈，小弟最近做肺克的MLST，但是有几个样本的两个管家基因一直扩不出来，但是其余的管家基因又能扩出来。DNA模版是新提取的，PCR体系也有调整过。

实在不知道是怎么回事，想问问各位有没有类似的经历？或者了解可能的原因？不胜感激。