求助|RT-qPCR时如何安排4组各6个生物学重复样本？
发布于 2021-09-25 · 浏览 959 · IP 北京北京
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如题，我们课题组按照不同干预将小鼠分成了四组，记为组A、组B、组C、组D。老板要求做qPCR每组有6个生物学重复。即目前有4组×6个样本，共24个样本。若要进行RT-qPCR，检测目标基因时每个样本需3次技术性重复，这样需要72个孔。若全放在一个板子上跑（实验室仪器仅能支持96孔），仅能测1种基因，且无法安排内参检测（如图1）。
问题1：如果按上图方式检测，可否内参基因单跑一板，一天内做的基因检测皆与那板内参进行比较？
目前还有一个替代方案，每个组取一个样本进行扩增，一共6个板子就可以把所有样本都测一遍，最终再将24个样本取均值计算相对表达，如图2:
问题2：如果按照上图方式检测，是否可以接受不同板子间的差异？
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 959
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