【求助】设计对细菌耐药性影响的试验问题。。。

我现在有一个表达纯化的蛋白，初步试验表明，能够增加绿脓杆菌对环丙沙星和头他的耐药性，用的是标准MIC法。对环丙沙星的MIC从0.5ug/ml上升到2ug/ml，对头他的MIC从16ug/ml上升到32ug/ml。
我想进一步证明到底是这种表达蛋白作用于肉汤培养基造成的细菌生长能力而增强对抗抗生素的作用，还是这种蛋白作用于细菌细胞膜封闭了抗生素进入细菌内部的通道，还是直接作用于DNA解旋酶或者青霉素酶造成对抗生素耐药性的影响，该分别用什么试验来证明才能做的比较系统一些像个完整的课题呢？主要是为了发表SCI文章。谢谢！
另外，打孔试验是不是排除蛋白对培养基的作用？