Trizol法提取总RNA
一、试剂与耗材
试剂:Trizol,氯仿(三氯甲烷),异丙醇,75%酒精(DEPC水配置),DEPC水,PBS缓冲液
1、Trizol:
Trizol中含有苯酚(主要物质,裂解细胞)、异硫氰酸胍(解耦剂,可溶解蛋白质并使其二级结构消失)、β巯基乙醇(破坏RNase蛋白质中的二硫键)、8-羟基喹啉(抑制RNase)等物质,可以迅速破碎细胞提取总RNA,同时保证RNA的完整性。
注:Trizol可以裂隙细胞,是一种剧毒物质,千万别接触到皮肤如果不小心碰到,要用大量的去垢剂和清水清洗。
2、氯仿
作为一种有机溶剂,主要用于分相,也有变性蛋白质的作用。可将水相中的苯酚抽提出来,RNA全部溶解于水样中。还可以去除脂溶性杂质。
加入氯仿离心后,EP管中溶液分三层,上层,中间层,下层。
注:氯仿是一种致癌物质,对心、肝肾有损害,吸入或皮肤吸收均会引起中毒,一定要佩戴手套噢。
3、异丙醇
通过-OH的疏水作用保护RNA链中的亲水基团,即可将RNA沉淀下来。
注:异丙醇具有较强的挥发性,对眼、呼吸道有刺激作用,大量吸入其蒸汽会引起面红、精神抑郁、恶性等症状。
4、75%乙醇
可溶解掉有机物杂质,也可洗掉异丙醇、氯仿试剂。乙醇易挥发,不用太担心残留对RNA的影响。
耗材:20μl、200μl、1000μl的qiang头,100μlPCR管,1.5ml及2ml离心管,qiang
二、提RNA步骤(以六孔板细胞为例)
提前将各耗材放进超净台,照紫外15min
1、 准备6支2ml离心管,作好标记,将六孔板中相应孔中培养液移至2ml离心管中,1000rpm/5min。同时每孔加入1mlPBS,轻轻晃动至覆盖全部细胞表面。(肿瘤细胞加药后有细胞漂浮,所以需要离心培养液,其他情况可忽略这一步)
2、 取出离心结束的2ml离心管,弃去上清,将六孔板中PBS按组别分别加入相应2ml离心管中,1000rpm/5min。同时每孔加入1ml Trizol,室温静置5min。
3、 取出离心结束的离心管,弃去上清。吹打孔板中的细胞,并将吹打结束后的Trizol细胞裂解液转移至相应离心管中,混匀,室温静置5min。
4、 按1ml Trizol 加200μl的氯仿,在每管中加入200μl的氯仿。盖紧盖子,用力震荡15s,在室温下静置10min,待其分层后,于12000g,4℃,离心15min。
5、 小心取出离心结束的离心管,准备新的6支1.5ml离心管,作好标记,用200μl的qiang小心吸取上清至新的相应的离心管中,大约吸400μl就够了,不能贪多,千万不能吸到下面的蛋白质。
6、 按氯仿:异丙醇=1:1的比例加入等量异丙醇,轻轻颠倒混匀,于4℃放置30min,(若是提取miRNA,建议负80冰箱过夜,只要前面操作没有问题,RNA纯度浓度在-80℃过夜不会有太多差别)
7、 将上述1.5ml离心管于12000g,4℃,离心10min。
8、 离心结束可见小小的白色沉淀,弃上清,每管加入1ml75%乙醇进行洗涤,可用qiang轻轻吹打一下,7500g,4℃,离心5min。
9、 取出离心管,弃上清,让沉淀的RNA在室温下自然干燥(在弃上清时,我会将EP管倒扣在干净纸巾上,这样可以减少壁上残留液体,更快干燥)。不能过干或有过多液体残留,干燥结束后,加入20-50μlDEPC水溶解(可根据细胞种类、样本类型调整加DEPC水的量),核酸亲水,会很快溶解于水中。
10、用Nanodrop one仪器测定RNA的浓度和纯度(OD260/280)。
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1.3 万