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受体氨基酸位点编号的疑问

发布于 2019-05-12 · 浏览 2303 · IP 四川四川
这个帖子发布于 6 年零 15 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

由于我是搞细胞生物的,偶然需要做一个药物的分子对接实验。

虽然我在 RCSB PDB数据库中查到了受体的晶体结构,并且,在相关文章中找到了药物与受体的结合位点。

但是我通过对这些位点的查询,发现查氨基酸的编号实则与受体亚型的氨基酸序列不一致。

并个例子来说吧,是乙酰胆碱受体,其由好几个亚基组成。每个亚基都有自己的氨本酸序列。

然后我在文章中看到的,也是鉴定了化合物与受体各种亚基的结合位点,并对位点进行了编号。如F230,N221等等。

但我反过来查这些亚基的氨基酸序列,发现其230,221位点却并不是F与N氨基酸。但我想文章应该不会错吧,有能帮我解释一下的战友吗?

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 2303

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