为何菌落PCR跑电泳出现阶梯形图像?
大家好!我在做给白色念珠菌某基因贴myc标签的实验。向菌体转入一段长片段后,要用菌落PCR鉴定上下游的完整性。今天上午我鉴定了下游完整性,结果跑琼脂糖凝胶电泳出现这样的图像。我还从来没P出过这样的图像。
最左边是1kb ladder,由下往上依次为:0.5kb 1kb 1.5kb 2kb 3kb。预期片段大小为448bp。
右边呈阶梯状的都是以转化长出的菌为模板P出来的。
PCR的反应体系 ddH2O 38.5μl
10×ExTaq Buffer 5μl
适量菌
三者 100℃ 5 min,冰上5 min。重复两次。
dNTP Mix 4μl
引物1(10μM) 1μl
引物2(10μM) 1μl
Ex Taq 0.25μl
反应条件 94℃ 5min
94℃ 30sec
54℃ 45sec 36cycles
72℃ 30sec
72℃ 6min
4℃ ∞
其中引物1使用 oligo calculator 计算得Tm值为52℃,引物2是54℃。
请路过的前辈帮忙看一下,为什么会P出这样的条带?不胜感激!
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 4047