科技文献检索与管理

1、Pubmed文献订阅

Pubmed（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed）是我们最熟悉的工具了，时不时要登录访问一下。但可能有些童鞋还不知道，这位老熟人还能主动登门拜访！平时只是混个脸熟，然而要用邮箱注册，才能让它也记住你，成为礼尚往来的好盆友啊~在首页的右上角：按提示填好邮箱密码并激活后，回到搜索界面，就以CRISPR为例，点击search后，搜索框下方会出现create alert。点击后跳转到my NCBI页面，会询问你是否愿意接受CRISPR相关新文献的订阅推送， 可以选择频率每月/每周/每天推送，点击保存就可以坐等文献飞送到你眼前了。 

2、文献鸟文献追踪

介绍一款免费的文献追踪的软件--Stork文献鸟，链接为（http://storkapp.me/?ref=liulin）。

在科研过程中，查阅文献与阅读文献是非常重要的。然而，查阅文献与对相关领域文献的跟进的能力使得像我一样刚开始接触科研的菜鸟力不从心。通常，我们浏览并且阅读的文献大多数来自于导师，但是一个导师会带领一个组做不同的方向，可能没有办法照顾到每个的方向。所以自行查阅文献的能力对于我们来说是非常重要的。只有我们能够跟上世界的科研节奏，我们才会占有主动，不然我们会发现，自己认为的创新性想法已经被很久之前就被刊出了。
这款Stork文献鸟，简单实用。我们只需要进入http://storkapp.me/?ref=liulin这个网站，输入你常用的邮箱地址并点击Sign up for free便可以实用该功能。当我们成功进入后，便可以在Add New Keyword中添加我们的关键词，关键词可以是研究方向、作者、机构、期刊等等和你研究方向相关的内容。例如，我的研究方向是静息态网络研究采用的分析软件是FSL，所以我可以在Add New Keyword中输入FSL、resting-state networks，回车后，你的关键词会显示在My Keywords中。可能你会担心输入的关键词过多，或者输入的关键词过于广泛，Stork文献鸟会不会每天给你发送很多邮件。答案是否定的，文献鸟会帮助你整理好选择影响因子高的，与你研究相关度高的文献发送给你。当然，你还可以在My Keyword的最后一行末尾，选择发送周期，文献鸟Stork可以每天或者每周发送给你最适合你的文献。

此外，文献鸟Stork可以高亮显示期刊名与其影响因子，可以帮助你筛选出你想要看的文章。

点击http://storkapp.me/?ref=liulin该网址，开始你的科研生涯吧。（注意检查邮箱中的垃圾箱，邮件有可能被国内的邮箱拦截）

3、杂志官网目标订阅

不知道你会不会对某些杂志情有独钟？和心仪的杂志多多接触，将来投稿也可以投其所好啊。一般从杂志网站都可以直接订阅该刊的内容，比如我就盯上了Lancet：

打开http://www.thelancet.com，用邮箱注册之后，只需要4步：点击My Account；选择Alerts选项卡；在JournalAlerts选项卡下面选择喜欢的子刊；选择推送频率。其他杂志也大同小异啦。
 

4、Mendeley自动推荐

咦，Mendeley不是一款文献管理软件么？没错，但它不仅是管理！平时我们用Mendeley存了很多文献了，都集中在自己关心的领域，那就可以用它的推荐功能直接获得领域内的相关内容。
访问https://www.mendeley.com/，登陆个人账号，然后就可以看到，网站会根据你的文献库里的文献推荐相关内容，还会贴心地提示，下面这两篇文献是根据你库里的哪篇来推荐的。
  
在个人主页的左边还可以设置自己的研究兴趣，例如肿瘤转移，保存之后主页上也会有相关推荐。要把这些相关文献推送到邮箱里来，也是从账户的settings里操作：


然后选择要接收的内容，比如newsletter updates和Weekly article suggestions。当然你也许会注意到软件左上方有一个“Mendeley Suggest”，这个功能正在开发，将来在软件里直接就能跟踪自己领域里的相关内容——不仅是追前沿，连历史都有可能主动帮你挖出来。 
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文献管理

有朋友经常被论文文献搞得头大，所以，今天就给大家推荐几个常用的文献管理软件，如果用的好，一定能够解决你的文献问题。

常用的文献管理软件大概首推EndNote了，但是除了 EndNote还有很多文献管理软件，有的是公开源代码，有的是免费。国产的也有几个文献管理软件。
1、Endnote
EndNote的功能强大自不必说。强大到何种程度，几乎没有它不能解决的问题，即使某些变态的极其复杂的引文和输出格式，也能轻松应对。除此之外，EndNote的强大之处还在于其自定义特性，通过自定义EndNote的输出格式，滤件和连接论文件。但是EndNote也有很多不足，比如分组只支持二级目录，EndNote也不支持标签。相比之下的Zotero这方面就强大的多，可以支持多级分类目录，还可以为文献打标签。其实这也都不是事儿，最主要的是EndNote是商业软件，对于普通个人用户，太贵了。不过EndNote厚道之处在于没有验证机制，只要有授权文件就能用，而且网上的授权文件一找就能找到。最著名的应该是同济大学的授权文件了，真是造福了不少穷学生。顺便说一句，以前的Reference Manager和ProCite这两个文献管理软件现在也被EndNote收购了。
EndNote 相关资源:
EndNote 官网
http://www.endnote.com/
Output Styles 下载
http://endnote.com/downloads/dla/styles.zip
Import filters 下载
http://endnote.com/downloads/dla/filters.zip
Connection files 下载
http://endnote.com/downloads/dla/connections.zip
Writing templates 下载
http://endnote.com/downloads/dla/templates.zip
EndNote 中文帮助https://www.howsci.com/endnote/
2、Mendeley
Mendeley功能非常强大，总起来说Mendeley有以下特点。免费，这个比较重要。支持多平台。迄今Mendeley有网页版，Windows版，Mac版，Linux版，甚至还有iPhone，iPad，iPod版。支持Microsoft Word, LibreOffice, and LaTeX等软件。支持PDF标记。可以直接在PDF文档中做相应的标记和注释，这样文章重点部分就可以重点突出了，下次再看时就知道重点和难点了。支持从其它参考文献管理软件导入文献，现在支持EndNote, Papers 和 Zotero。可以组织管理文献，通过文件夹的形式把文献分类，管理起来文献简单明了。可以和同事们分享文献，甚至注释和标记也可以分享。这样大家协作起来更方便。支持网络备份，而且多个平台之间支持同步。支持PDF文件导入并自动提取文章信息，支持自动导入特定文件夹内的文献。强大的搜索功能，可以搜索PDF全文。强大的社区功能。这才是Mendeley的精髓所在。现在新兴的文献评价标准Altmetric参考因素之一就包括Mendeley的社区功能，如利用Plum Metrics评价系统了解论文的关注度分享情况。ResearchGate科研人员自己的FaceBook其中一项指标也包括Mendeley的社区。
Mendeley 相关资源
Mendeley 官网https://www.mendeley.com/dashboard/
Mendeley for Windows
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/windows/instructions/
Mendeley for Mac OS X 10.6+
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/mac/instructions/
Mendeley Desktop for Linux
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/linux/
Mendeley for iPhone, iPod Touch and iPad
https://itunes.apple.com/gb/app/mendeley-reference-manager/id380669300

3、Zotero
Zotero是一个开放源代码的文献管理软件。Zotero特色之处是可以作为浏览器插件进行使用。本地的Zotero的文献数据库还可以免费上传到Zotero的网络服务器上，并且不受空间大小限制。但是本地的Zotero的附件，在网络服务器上有大小限制，Zotero的网络服务器仅为每用户提供300M免费存储容量。otero和EndNote也曾干过仗，2008年, 汤森路透起诉 Zotero 侵犯了EndNote的最终用
户许可协议 (EULA)，逆向工程了EndNote，提供了Zotero把EndNote私有的 .ens风格转换为Citation Style Language风格。Zotero相比于EndNote，免费不用说，最大的特色是无限级的目录分类，一个目录下可以分为多个子目录。这样管理起来文献就方便多了，而EndNote只支持二级目录。Zotero还支持文献的标签功能。为每个文献自动打上标签，当然用户也可以自定义标签，这又增加了文献管理功能。不过Zotero的插入引文和参考文献相比于EndNote来就弱了许多，支持的输出格式也相有效，只是支持几个大类的输出格式，并没有具体的杂志格式。可能我的理解有错误，但是至少现在我还没找到修改或者添加引文格式的方法。
Zotero相关资源
Zotero官网
https://www.zotero.org
Zotero for Windows
https://download.zotero.org/standalone/4.0.28/Zotero-4.0.28_setup.exe
Zotero for Chrome
https://chrome.google.com/webstore/detail/ekhagklcjbdpajgpjgmbionohlpdbjgc
Zotero for Firefox
https://download.zotero.org/extension/zotero-4.0.28.3.xpi
Zotero for Safari
https://download.zotero.org/connector/safari/Zotero_Connector-4.0.21-1.
safariextz
4、JabRef
JabRef是一个开放源代码、处理BibTeX格式的文献管理软件，提供了简易操作的界面来编辑BibTeX档案。 功能包含从网络上的科学数据库汇入资料，以及整理和搜寻BibTeX档案等。JabRef的发布遵循GNU通用公共授权条款。软件则是用Java作编程，可以使用于各种操作系统，如Windows、Linux、Mac OS X。
JabRef最初的版本发布于2003年11月29日。其名称JabRef代表着Java、Alver、Batada、Reference。其中Alver 和Batada分别为Morten O. Alver 和 Nizar Batada，两位最初的开发者。
JabRef 相关资源
JabRef官网http://jabref.sourceforge.net/
JabRef最新稳定版下载
http://sourceforge.net/projects/jabref/files/jabref/2.10/
5、NoteExpress
NoteExpress是一个国产文献管理软件，据说对中文文献和中文数据库的支持比EndNote好。在国内也有不少用户，不过这个软件是商业软件，学生版198，永久版需要 698 元。但是有这钱我就用Zotero，因此对NoteExpress 一直不感冒。网上也有**版的，但是也没有尝试过。顺便说一句，尽量不要使用**版的软件。
NoteExpress相关资源
NoteExpress官网
http://www.inoteexpress.com/
NoteExpress购买
http://www.inoteexpress.com/CompanyWeb/cartstart.do
暂且就先列举这些吧，虽然未难全部，但是也能供大家做个选择了。基本上这些就是主流的文献管理软件了，如果你能够用好其中一个，基本上就能够解决让人头疼的文献问题了。
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总结，只要我们想要去做这件事情，无论用什么办法都可以，这些工具软件只是辅助手段，核心还是我们要有一颗踏踏实实的心。
任何问题可以发送至liulin0809@gmail.com