求助,miRNA扩增不出来,不知道是引物问题还是别的原因
想做miRNA的qPCR,用一个生物公司的软件,茎环法设计了反转录引物,和PCR上下游引物。
没有买miRNA的试剂盒,用Trizol法提RNA,普通反转录试剂盒,仅是把引物换成了自己合成的引物。
反转录时RNA上样量1ug,PCR扩增,cDNA上样量4ul。然后跑PAGE电泳,胶浓度20%。
内参条带很清晰很亮,三个miRNA仅有一个跑出条带,但条带后面还有一个弱的带,不知道是什么。另外两个miRNA均没能跑出来。
刚开始以为是退火温度不合适,就设置了温度梯度,从51到63℃,六个样品,仪器自动均匀分布温度。结果发现温度对结果并没有影响。
是因为模板量太低了吗,那两个没跑出条带的RNA是miRNA184和miRNA4472。
科研新手,没想到刚开始的一个简单的PCR就把自己给困住了,求助各位大神解答,谢谢谢谢!!!

