【求助】haploview

各位战友好，想请教如下：
1、在连锁不平衡分析时，我们都知道r的平方值或D‘为1代表完全连锁不平衡，当两个SNP位点完全连锁不平衡时，一个位点就可以代表另一个了，那么当同一个基因上的两个SNP之间的D’值接近1但r方值接近0时，这两个SNP还有都研究的必要吗？是不是只要做其中的一个就可以了呢？我做的是基因多态与疾病的关系。
2、使用haploview分析连锁不平衡的时候得到的LD Plot图中，各个方块颜色由浅至深表示连锁程度由低到高，深红色表示完全连锁，但是很奇怪的是，我使用haploview得到的某个基因的LD Plot图颜色深的方块r方值都接近1色浅的方块r方值反而接近0，所以我想问一下haploview的LD Plot图中r方值是不是跟我们平常理解的r方值意义相反呢？

谢谢！