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[原创]【NGS数据分析经验分享】1-2 配置VMware磁盘共享

医师 · 最后编辑于 2018-01-06 · IP 美国美国
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这个帖子发布于 7 年零 170 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

【目录贴】

VMware虚拟机软件允许虚拟机系统(Linux)访问主机(Windows)的目录。这就方便我们把需要分析的数据文件放在计算机的特定目录里,而不必复制到虚拟机里(NGS数据一般都很大,复制的话既慢又浪费资源还不方便)。当然,如果你喜欢一切都在Linux下操作的话,也可以略过这一步。我是比较习惯在Linux下分析数据,然后回到Windows用Rstudio和Excel等工具做统计分析和作图(没办法,单位只提供Windows)。

在设置VMware共享目录之前,需要在Linux里安装驱动程序。还记得在上一节安装Linux的时候黄色的提示吗?(如果不见了也不要紧,下面会找到它)

img

这是VMware自带的Linux驱动程序。我们需要进入到Linux中来安装这个驱动程序。登陆你的Linux。如果黄色提示框还在,点击“Install Tools”,如果不见了,按照下面操作。

img

这时候我们点击VMware软件中“Player”,“Manage”,“Reinstall VMware Tools…”

这时在Linux桌面上会出现一个光盘图标。

img

双击光盘,里面有几个文件。其中那个纸壳箱子文件(VMwareTools-10.1.15-6627299.tar.gz)就是我们需要的。

img

点击“Application”中的“Terminal”启动一个终端。从现在开始,我们要尝试熟悉终端操作(在黑黑的或者白白的窗口里面敲命令)。

img

在Linux终端中,使用命令把这个文件复制到你的用户目录里(关于如何使用Linux命令,请参考有关教程)。为了目录结构清晰,我把这个文件复制到我的主目录下面的Downloads目录里,命令如下:

[bionux@localhost /]$ cd

这确保回到用户主目录下面,也就是/home/用户名。其实你只需要敲cd并回车就可以了,前面的提示字符串[bionux@localhost /]$不要敲。为了避免赘述,下面就直接给出命令。

cp /run/media/bionux/VMware\ Tools/VMwareTools-10.1.15-6627299.tar.gz Downloads/
cd Downloads
ls

img

终端显示红色的文件。下面解压缩这个文件,并进入解压目录。

tar zxvf VMwareTools-10.1.15-6627299.tar.gz
cd vmware-tools-distrib/
ls

img

目录中绿色的文件是Perl安装脚本,需要管理员权限(sudo)进行安装。运行下面命令开始安装(如果直接运行,会给出错误提示)。

perl vmware-install.pl

sudo perl vmware-install.pl

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需要输入你的密码。之后会询问一系列问题,不用修改,直接按回车。其中有个步骤是询问是否开启主机系统和虚拟机系统共享目录,当然要选yes(默认)。

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如果你在执行驱动程序安装时有各种错误提示找不到这找不到那,说明你没有按照上一节Linux安装指南选择必要的软件包。如果提示你不是管理员,说明你没有按照上一节的指南,把你自己设置成管理员。出现这些情况,请上网寻找解决办法,或者按照上一节的指南重新安装,或者找大神(不包括我)帮忙。

正确安装完成后,系统会提示安装成功。

img

这时,我们关闭Linux。

img

点击右上角的关机按钮。

img

选择“Power Off”关机。

img

关机后,VMware虚拟机软件也会自动关闭。重新打开它。在左边选择虚拟机,右边选编辑,打开设置对话框。

img

依次点击“Options”,“Shared Folders”,“Always enabled”。然后点击“Add…”打开添加共享目录向导。

img

按照提示,选择你的共享目录。

img

最好选择一个剩余空间较大的硬盘创建一个共享目录,并给目录起名。这个名字(而不是Windows里的路径)将会出现在Linux系统里面。

img

除非有特殊需要,否则不要选“Read-only”,我们还得在Linux里面向目录里写东西呢。然后点“Finish”,点“OK”。点“Play Virtual Machine”启动虚拟机并登陆你的用户。

打开终端,运行下面命令。

cd /mnt/hgfs/
ls

img

如果你看到一个绿底的目录(名字是你刚才起的),那么恭喜你,成功了。为了方便使用,我们回到主目录,创建一个指向这个共享目录的软链接(类似Windows里的快捷方式)。

cd
ln -s /mnt/hgfs/workspace workspace
ll

img

以后访问这个共享目录,只需要访问主目录下的这个软链接就行了。而且,如果驱动程序失效(比如你更新了系统内核),这个软链接会变成红色,方便诊断。

【回到目录】

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