用R做的,两组芯片 A组15个样本,B组14个样本,copy其他人的代码做的,这样的图和别人论文里的图片差别好大呀 ,FC取1.5也差不多,代码如下:
diffSub=subset(allDiff,allDiff$adj.P.Val<0.05 & abs(allDiff$logFC)>1)
points(-log10(diffSub$adj.P.Val),diffSub$logFC,pch=20,col="red",cex=0.4)
abline(h=0,lty=2,lwd=3)
dev.off()
想问下大家这芯片还可以继续找差异基因么?能制作出正常的火山图么?谢谢各位了!