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求助,火山图分析制作问题

屏蔽用户 · 最后编辑于 2022-10-09 · 来自 Android · IP 广东广东
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这个帖子发布于 8 年零 170 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

用R做的,两组芯片 A组15个样本,B组14个样本,copy其他人的代码做的,这样的图和别人论文里的图片差别好大呀 ,FC取1.5也差不多,代码如下:

diffSub=subset(allDiff,allDiff$adj.P.Val<0.05 & abs(allDiff$logFC)>1)

points(-log10(diffSub$adj.P.Val),diffSub$logFC,pch=20,col="red",cex=0.4)

abline(h=0,lty=2,lwd=3)

dev.off()

想问下大家这芯片还可以继续找差异基因么?能制作出正常的火山图么?谢谢各位了!










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