【求助】致病基因筛查的目标片段是CDS序列还是mRNA序列啊？

前辈们好！
小弟近来做人类疾病PCR筛查遇到难题：人类致病基因筛查的目标片段是CDS序列还是mRNA序列？
大家都知道，mRNA序列与CDS最大区别就是有5＇端和3＇的UTR，这一头一尾在测序中需要囊括进去吗？
看到一些文献写的不一致：有的在CDS之外专门去测了5＇端UTR，可又没有把它完全囊括，是什么讲究？