质谱几种扫描模式介绍

靶向代谢组学：对已知的代谢物进行定性定量。用的设备多是QQQ。扫描模式是MRM（多反应离子扫描）

三重四极杆( Triple quadrupole ，QQQ)最常用的扫描模式是MRM（多反应离子扫描）其主要原理就是Q1 选择特定母离子，再送入Q2 碰撞池碎裂，Q3 选择母离子特定的碎片子离子进入检测器。

优点：1 定量准确高， Q1筛选出A,Q2将A碎裂为a b c ,Q3 检测a b c的强度，层层把关，识别待测物更准确。

2、选择性高，性噪比高，灵敏度高，通过Q1和Q2双重选择，限定了母离子和子离子的质荷比。与单通道相比，选择性更高。

3、多指标检测，可自动化操作，

4、可使用同位素内标

非靶代谢组学：代谢物未知，含量未知。用的设备很多，液质如QTOF、QE，气质TOF。与靶向代谢组学的固定分子量不同，非靶代谢组学检测的物质分子量跨度非常大（15-1500），这要求质谱仪的质量范围比较宽和分辨率比较高；然而各种分子的含量都是相差特别多（经常都是10^12以上），要求质谱动态范围和灵敏度比较大。 因为目的不同，扫描模式是full scan，根据具体情况又分多种

 full scan：全扫描，最大地收集所有离子信息。常见有以下3种方式，常用的是DDA扫描模式

DDA（Data Dependent Acquisition）：依据预先设定的条件，预先筛选母离子，最终结合一级质谱和二级质谱的信息。这个方法优点是干扰较少；缺点是重复性差。现检测一级再根据特征峰检测二级

DIA（Data Independent Acquisition）：不预先筛选母离子，低能量是获得一级质谱，高能量获得二级质谱，在理论上能获得所有的碎片信息。缺点是无法对二级质谱的来源进行判断，需要专业的工具。一级二级同时测

SWATH 是DIA的一种，但将检测的质量范围分为以某一宽度为单位的多个连续的区间，然后对区间内的离子进行碎裂获得其碎片信息。由于采用了相对于传统DIA较窄的m/z窗口，因此可以获得相对干净的二级质谱图。缺点还是DIA的缺点。MS/MS覆盖率：DIA>DDAMS/MS 质谱图质量：DDA>SWATH>DIA 。用气质做非靶向保留时间稳定性优于液质非靶向，所以液质非靶向更需要高分辨质量分析器。