专硕研究生：生活杂谈（科研论文篇）

本人目前研二在读，专硕带规培，开帖记录科研论文学习，选题，撰写，投稿历程等感悟；

虽然目前还没有SCI见刊，但仍报有迟早会发表的信心，顽强的在自己的节奏上蹦跶，万一成功了呢；

目前四篇SCI在投，包括一篇大修等结果；一篇在大修；一篇4.8分送外审核；一篇外审后因为方法问题拒稿，题目方向很新，下一步有时间继续修改；

我一直相信一句话，努力了不一定成功，但不努力一定不成功！

一、我与论文初相识

想写一篇论文最开始的启蒙阶段是以前工作时带过我的主任（H老板）。有天我跟他提到我想写一个文章，H老板第二天就把他之前随访的一部分数据还有几篇参考文献给我，并告诉我先读别人的文献，数据统计你一时半会学不会可以让L研究生帮你算一下。现在回想起来，工作后遇到这样的主任、领导、同事实属不易。

但最后由于工作太忙、考研等问题文章并没有成初稿，我的想法因此难产。

二、Paper再续前缘

时间转眼过了2年，到了2020年12月份；

一天，现任老板突然让我们选个研究方向写个综述，为毕业论文打基础；这是直接促成我做一件事的理由。另外也包括其他的一些执念。

刚开始看到研究方向，不知从何读起学习；这里分享关键点：B站，某宝，某云。只要搜索关键字，方法套路一大堆，这里我建议花半天时间去研究，记录，并初作尝试。

我个人对于这一块的理解是一定要亲手操作，另外，建议直接用一些原文数据去实际计算。并不断查找问题反馈解决。

科研起步阶段。我是从meta分析开始也建议大家从这个学，这个阶段要学会三点：第一主流网站文献检索；第二写作统计软件熟悉（推荐R语言，STATA，revman，endnote）；第三看其他人写的文章有意记录一些小的灵感（后边有大作用）。

6月29日更

昨天刚开贴，文章就被接受了，人生首篇，刚好一晚上夜班，也没咋睡。

主流文献检索网站：只用pub、embase、考科兰。教程b站一大堆，自学即可。（大概需要1多半天时间熟悉完）

统计软件：我首推R语言，单应用之前需要自学简单的语句，另外其他公众号教程代码都是现成的，拿过来用啊！软件管理用endnote写文章必用！

三、选题

第二段讲过，在你查找相关文献，会产生一些灵感，那时候记录的东西就是你接下来选题的源泉。注意一：选的题目最好有2篇类似的已发表的文章，或者有相同套路的文章，备用，因为写作的时候一定按照已经找好的文章顺下来。简单来说，先模仿，再创造。重点在于研究设计和方法统计学两点。

7月1日更

首先祝共产党节日快乐，我一直在向党靠拢，时刻准备着！

三、选题（续）

选题对于写meta分析太太太重要了！这个不经历1次刻骨铭心，体会不到后期提取数据的痛苦。

四、软件和硬件技巧

基础的电脑，简单的计算：我的古董机惠普g4可以运作。如果难点的，比如R软件拟合一个复杂函数，用MACpro跑，在做预测模型时跑一个DCA大概需要30秒，而用惠普g4，每次卡死数分钟才出结果。如果涉及到调整参数，每动一个参数跑一次就是半分钟，经验好的试几次就能出不错的图，如果没经验，会很抓狂。所以，我建议配一台高配电脑，这样在你摸索前进中会省很多时间。

软件：如果没资源，就去某宝买一个软件，比如endnote，stata。R软件虽然免费，但是好的代码需要去自己摸索，开发，修改（所以需要花段时间学习基础的R语言，这里建议专项学习，遇到需求就百度找答案）。还有就是有些课程里面会有现成的代码，拿过来用就好。

以上配置，建议能高配别低配。这点投资和SCI产出收益来说，真的不值一提。

五、写作顺序

从这节开始我就以我发的预测模型为例子说明。

提取数据：将数据库下载好的数据，简单整理成统一格式。然后，参考其他的已经发表文献表格将数据清洗。不要完全抄，修改几个点。比如其他人年龄分了四组，你可以把年龄分3组；这一步挺重要，分组别太多，分的越多，后边遍代码越费劲。最多一个变量不要超过四个。比如：肿瘤大小分小于1cm，1-4cm，4cm以上。

简单的临床数据提到excel表，将数据做清洗。变成数字，另外再准备一个数字对应实际意义表格。

写到这我觉得有点说不清，不过没关系，我尽快找时间用最简单方法录成视频传上来。

7月4日晨

昨晚把一篇大修的发过去了，很第一次比起来，心情比较能拿捏住。

写作顺序（续）

作图：上边得到清洗好的数据，用R跑图。（这里需要注意，第一次做可能出来的结果和图不理想，比如C指数低，ROC低，这里有几个可以微调的方法：第一，我用数据库内部验证随机化分配数据，模型拟合的不满意，可以再随机化一次；第二，提出来的数据没必要都应用上，比如诊断年份，这个变量是有文章发出来的，但我没有使用；第三，实事求是，我做出来的C指数65%，第一次大修被编辑提问，我如实回答，并给出理由为在病例选择存在偏移，是文章局限性之一，以后改进三连击，态度诚恳，编辑遍一把通过。各位修改文章可以用的小套路。

R语言作图：这一块挺难的，需要找代码，而且每次找的不同人的，他们用的包不一样，很麻烦。我是废了特别大的功夫去学习了R，然后自己比葫芦画瓢，跑程序失败无数次才做出来图，尤其是DCA作图会比较麻烦，图的颜色每个人做出来的也不同。建议自己学一个就行，最好自己手敲一遍代码，不然即使给你现成的你也不知道如何使用。人生经验：学方法，虽然慢，后劲足。

然后顺利成章结果、简介、讨论、摘要。

讨论部分写作：这一块毫不夸张地说，3天写了2句话，大修回来全改了！

解决办法：逻辑思维。编辑说我的讨论毫无意义，因为无逻辑可循。我后来按照变量对模型影响的分由高到低去写，最后通过。这只能算一点经验吧。另外建议读高分文献讨论，低分文献看看结果图个乐子，懂得都懂，无须多言。

7月5日更

七、投稿

原则：从高向低

其实我投稿的心态比较好，一是没有必要要求必须发；二是本着有最好，没有也应该的心态。投第一篇就投了顶刊STROKE（IF-7.9），结果是被拒了，但没有完全拒；建议转投他家旗下JAHA（IF-4.5），没毛病，顺利送外审，大概一个月后，两个审稿人意见很尖锐。编辑决定拒稿。行啊，来，继续投3分多的。绝绝子，第二天拒。第四次投的2分，ok，送外审，6月26日编辑让major revision。

第一个审稿人我太爱了，他说很有新意，而且meta分析的统计学方法是high quality，然后就一段，没有下文了。我本身是一个特别敏感的人，再加上前边的决定信内容，我分析这个reviewer #1不出意外是一个这个副主编。所以，我就对他跟出的评论一顿赞美的虎狼之词，再加上对杂志影响力给予了高度认可，最后再次感谢了他。就没了，至于啥结果，前天7.3已经把大修发回，等有结果再说。

第二个审稿人超级认真。总结来说就是我文章有两个结果解释需要讨论；而且建议我把分子机制加上，他竟然给出了我要加上哪个因子的名称；第二，几处语句可能有歧义，需要更正语句顺序和拼写；第三，指出设计缺陷，虽然有趣，但是结果选择arbitrary。我给出的回应就是把审稿人提出的看法在讨论部分加上，设计缺陷放在了limitation里说以后改。总体原则：你让改啥，咱就改啥；改不了的，说原因，努力过，没成功，写结果，说以后改；我膝盖软，算命的说我适合吃软饭，我只能全部thank you开头回答所有问题。

第三个审稿人和第二个意见差不多，所以，我复制的第二个回应粘贴来的。

选刊投稿流程就这么多，我已经努力了，这篇meta接受最好，毕竟我是从7.9分投下来的；不接受我在找找1分多的试试呗。

总之，有苦有乐，最难过讨论写不出来，心态崩溃，最开心也就是accept。我是一个双面性格O型血的人，可能现在读起来这篇杂谈感觉很好笑，有趣，但其中背后的付出只有经历过才会明白呀。

希望对科研刚起步的同学一点点启发，另外我觉得院子里的人都是希望进步的，评论我都有认真看，需要我回复的我也认真回复每一个爱科研的铁汁。

也有说我很厉害的虎狼之词，我首先感谢铁汁认可，另外，我这个方法写的东西缺少实验室实际操作，我今后有经费了我会尝试做实验，那时候我就又成了一个小白。我的意思是，每个人都有熟练的领域，当你把自己熟悉领域的事情告诉别人，对他人来说是一种分享，会让人少走弯路。对自己来说，算是能够更全面清楚我能做什么，我擅长做什么，我不会做什么，摆正自己的位置。这样我跟院子小伙伴沟通才能双赢呀！

正文更新完毕。2021年7月5日午睡刚醒