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metaboanalyst进行代谢组学数据分析

发布于 2020-12-11 · 浏览 853 · 来自 Android · IP 上海上海
这个帖子发布于 4 年零 151 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

大家好,在用metaboanalyst进行代谢组学数据处理的时候,想请教大家几个问题。在前边我进行了滤过缺失值超过50%的行,KNN进行缺失值填充,过滤掉RSD大于30%的离子峰,之后进行选择了sample normali by sum,none data transformation ,分别用三种方法进行了data scaling,得出来的整体数据分布图各不相同,想请教大家1是不是采用 range scaling的那张图更符合正态分布 2pareto scaling是不是在代谢组学中用的更多,但是在这里的处理结果不如range scaling 3前边的数据处理中是不是有些待改进的。非常感谢  

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最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 853

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