【原创】SPM8入门级---实验结果DICOM格式转换为hdr和img
在拿到实验结果数据时,大多数都是DICOM格式的,这个格式的文件是没有扩展名的。那么这种格式是不能被SPM所处理的,所以要进行格式转换,可以使用SPM8自带的DICOM Import工具进行转换。
在此我把spm8手册上的第20章 DICOM Import给大家展示出来,同时附上自己操作的步骤截图。
SPM8 Chapter20
DICOM Import
DICOM转换:本步骤目的是要把DICOM格式转换成SPM能识别的格式,转换后会被写入到输出目录中.但SPM并不能转换所有的DICOM,因为它是一个非常复杂的格式,并且一些扫描仪器有它们自己独有的格式.
20.1 DICOM files
选择DICOM文件去转换
20.2 Directory structure for converted files
转换后的目录可以使用4种不同的方式去命名.
1.`日期-时间`方式命名 子目录也是同样的命名方式,好处是可以在你无法识别数据来源时进行研究
2.`病人ID`方式命名
3.`病人名字`方式命名
4.不分层级的目录:把所有转换完的文件放在一个目录中
20.3 Output directory
选择输出目录
20.4 Conversion options
20.4.1 Output image format
DICOM将会转换成分开的img和hdr文件,或者两者整合在一个文件中.整合在一个文件中会帮你节省硬盘空间,但是会与那些不识别NIfTI的软件不兼容.在某些情况下,只会产生3D图像.
20.4.2 Use ICEDims in filename
当文件有重名的时候,若图像文件名分配失败,可以用 SENMENS ICEDims 信息去建立统一的文件命.
下面附一些截图:
选择DICOM Import
[img]file:///C:/DOCUME~1/ADMINI~1/LOCALS~1/Temp/LKTXO{8[2DQ%P7KX8VN4BVO.jpg[/img]
选择数据来源 PA:Patient /ST:Study /SE:Series /IM:Image
[img]file:///C:/DOCUME~1/ADMINI~1/LOCALS~1/Temp/ST6WEW3K{@6D]${D_)P9IVM.jpg[/img]
点rec并且Filt处为.*就可以选择全部文件,Filt是个过滤器.
选择所要输出的目录 ./表示目录所在路径 ../表示目录所在的上一级路径 此处右边选择./
[img]file:///C:/DOCUME~1/ADMINI~1/LOCALS~1/Temp/`14J888K0QX%K)WTNVRK5M7.jpg[/img]
spm8手册 可以在SPM官网上下载
能力有限,其中出错的地方,还请高手们多多指正。