细胞生物与生物信息 - 丁香园社区 - 第33页

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丁香园社区细胞生物与生物信息

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阿趣代谢组学

医疗行业从业者

2024-10-28

干货分享 | 利用STRING联合Cytoscape绘制PPI网络图

简介1.PPIPPI（Protein-protein interaction），蛋白质-蛋白质相互作用。网络图中的节点代表蛋白质，连线表示两个蛋白质之间存在关联。蛋白质是基因表达的产物，通过了解蛋白质分子之间的关联性从而间接了解基因之间的相关性，进而挖掘核心的调控基因。2.STRING数据库STRING数据库是蛋白质相互作用的数据库，覆盖物种多，蛋白数量多。数据库目前包含14'094个物种和67'592'464 个蛋白质。其中string数据库中的数据来自包含Biocarta, BioCyc, GO, KEGG, and Reactome在内的5个数据库。关系得分表示可信度，分越高越可信。3.

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1072 浏览 · 1 讨论

病理科医师

2024-10-28

求助载体构建

构建的载体，两个蛋白共用一个启动子，第一个蛋白的终止密码子和第二个蛋白的起始密码子之间的碱基数需要3的倍数吗？期待各位大佬解答！

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十三噗噗柚

遗传学其他学科医学生

2024-10-28

慢病毒侵染3t3l1细胞

慢病毒侵染12h后出现很多小黑点，是分泌物吗，还是污染呀，应该怎么处理呀

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163 浏览 · 2 讨论

医疗行业从业者

2024-10-27

细胞系交换

本人有以下细胞系，实验室另有一些其他的小鼠细胞系，与站友交换其他细胞系，本人急需Hepa1-6，EO771K562 人慢性粒细胞白血病细胞 Jurkat 人T淋巴细胞白血病细胞 A549 人非小细胞肺癌细胞 THP1 人急性髓细胞白血病细胞 PC-9 人肺癌细胞(分化型) DLD1 人结直肠腺癌细胞 AGS 人胃腺癌细胞 PC-3 人前列腺癌细胞 HepG2 人肝癌细胞 HL-60 人早幼粒白血病细胞 MGC-803 人胃癌细胞 HGC-27 人胃癌细胞 (未分化) Caco-2 人结直肠腺癌细胞 HepaRG 人肝细胞 Hela 人宫颈癌细胞 Huh-7 人肝癌细胞 4T1 小鼠乳腺癌细胞

281 浏览

消化内科医师

2024-10-27

提取人中性粒细胞

想提取新鲜人血的中性粒细胞。请问建议用谁家试剂盒，另外用哪种抽血管，是血常规的还是肝功的紫管？

2666 浏览 · 13 讨论

2024-10-27

将重组质粒转入感受态细胞后用涂抹法在平板(含氨苄)上培养，长出几个菌落。但其阳性对照(将含氨苄抗性基因的质粒导入同种感受态细胞)无菌落。这是什么原因？

125 浏览 · 1 讨论

病理科医师

2024-10-26

3D培养小白，想做3D侵袭实验，看过相关文章的实验方法，只了解了大概，哪位大神好心分享下具体的实验步骤，不胜感激！！！

223 浏览 · 3 讨论

麻醉生理学医学生

2024-10-26

求助高通量筛选方案

ZNStress：一种高通量药物筛选方案，用于鉴定调节肌萎缩侧索硬化症转基因突变体sod1G93R 斑马鱼模型中神经元应激的化合物，化合物特性描述是什么啊？哪些化合物容易获得？

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医学检验/实验诊断学医学生

2024-10-25

求助，换胶质瘤细胞系，我有U251,U87,以及A172，想换LN229或U118细胞系。

124 浏览 · 2 讨论

预防卫生其他学科医学生

2024-10-25

A549细胞siRNA转染的SCI文献分享再+1~

复旦大学研究团队在探究G蛋白信号调节因子20（RGS20）在非小细胞肺癌放射抗性中的潜在作用相关研究中，使用RFect siRNA转染试剂将靶向RGS20的siRNA转染到人非小细胞肺癌细胞株A549细胞以及放射抗性细胞系A549R细胞中进行敲低实验。western blotting的结果显示，转染后与对照组相比，两种细胞中RGS20的蛋白表达与对照组相比均有所降低。相关文献：Radiation Medicine and Protection. 2024 Sep;5(3):178-184.

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241 浏览

中医内科学医学生

2024-10-25

求助，新人指导

老板以前也缺少实验室，专硕上来的，基础实验欠缺，有没有老师指路我应该从哪开始细胞动物实验的学习，有没有系统的课程。现在刚刚一年级，马上应该就有实验了。感谢大家帮助

205 浏览 · 6 讨论

2024-10-25

生物信息学札记(第3版)

没想到浙大樊龙江教授的《生物信息学札记》这么深受大家喜爱，一个03年的帖子还被大家顶起来，许多战友都在跟帖寻求这本小册子的下载信息。其实，这本讲义历经4版，目前已经有第四版出版，感兴趣的同学可以到下面红框里的网站上详细了解。园子里原来发的多数为该讲义的第一、第二版，且链接大多已经失效。我提供的这个第三版讲义，可能也是来自丁香园，现贴出下载链接，方便战友们下载学习。有兴趣的战友还是购买原书，多支持支持第4版。https://pan.baidu.com/s/1rMcSS6PwjuYXmr3RTMIN8g

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6275 浏览 · 7 讨论

普通外科学医学生

2024-10-25

求赠STR鉴定过的C4-2B或C4-2细胞

求赠STR鉴定过的C4-2B或C4-2细胞（非国内公司购买）！可用试剂交换。

387 浏览 · 3 讨论

临床医学其他学科医学生

2024-10-25

求胃癌细胞系SNU16

求SNU16！！可交换细胞本人有B16，SNU601，MKN45，NUGC4，KATO III，MFC等等

371 浏览 · 7 讨论

医师

2024-10-24

Phenomics | 加拿大阿尔伯塔大学和复旦大学联合开发基于文本、音频和视频的多模态抑郁

Phenomics | 加拿大阿尔伯塔大学和复旦大学联合开发基于文本、音频和视频的多模态抑郁症检测与评估方法近日，由加拿大阿尔伯塔大学，复旦大学陈颉教授领衔的研究团队在国际期刊《表型组学》(Phenomics)上发表了一篇题为“Multimodal Approach for Detection and Assessment of Depression Using Text, Audio and Video”的研究论文。该研究提出了一种创新的多模态融合模型，用于抑郁症的自动检测和评估，取得了显著的性能提升，为心理健康领域的研究带来了新的突破。论文DOI链接：https://link.spring

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医师

2024-10-24

Phenomics | 四川大学华西医院宋欢团队联合卡罗琳斯卡医学院、冰岛大学

Phenomics | 四川大学华西医院宋欢团队联合卡罗琳斯卡医学院、冰岛大学揭示常见精神疾病患者的心血管疾病住院风险模式与轨迹近日，《表型组学》（Phenomics）在线发表了四川大学华西医院生物大数据研究院宋欢研究员联合卡罗琳斯卡医学院、冰岛大学题为“Risk of cardiovascular disease hospitalization after common psychiatric disorders: analyses of disease susceptibility and progression trajectory in the UK Biobank”的研究论文。该研究

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医师

2024-10-24

Phenomics | 川大杨浩、戴伦治，中科院杨刚龙，北大吕继成教授共同评述糖基化定量方法

近日，《表型组学》（Phenomics）在线发表了四川大学杨浩教授、戴伦治教授、中科院杨刚龙教授、北京大学吕继成教授题为“Site-specific quantitative N-glycoproteomics: the great clinical application potential of GlycoQuant”的评述论文。该论文对中国计量院赵洋副研究员、华西医院张勇副研究员等人发表在Phenomics 研究性论文“A novel integrated pipeline for site-specific quantification of N-glycosylation”进行了系统

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医师

2024-10-24

Phenomics | 复旦大学洪尚宇团队发现饲养环诱导的代谢变化境通过调节肠道菌群改变小鼠

Phenomics | 复旦大学生命科学学院洪尚宇研究员团队发现饲养环境通过调节肠道菌群改变小鼠生酮饮食诱导的代谢变化近日，《表型组学》（Phenomics）在线发表了复旦大学生命科学学院洪尚宇研究员团队题为“Living Conditions Alter Ketogenic Diet-induced Metabolic Consequences in Mice through Modulating Gut Microbiota”的研究论文。论文DOI链接：https://link.springer.com/article/10.1007/s43657-024-00161-1论文pdf链接：h

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医师

2024-10-24

Phenomics | 中国中医科学院仝小林院士团队发表“基于糖尿病探讨中医药表型组学研究”

近日，《表型组学（英文）》（Phenomics）在线发表了中国中医科学院仝小林院士团队题为Investigation on Phenomics of Traditional Chinese Medicine from the Diabetes的综述文章。该文章系统总结了糖尿病不同类型、不同阶段、不同证型的表型特点，以及中医药治疗前后的表型变化；提出在“态靶辨治”理论指导下，应用表型组学促进中医药创新发展。论文相关链接论文DOI链接：https://link.springer.com/article/10.1007/s43657-023-00146-6论文PDF链接：https://link.s

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医师

2024-10-24

Phenomics | 复旦吴俊杰、宋元林，南医大沈波，长海医院黎正行揭示MBD4基因rs140693多

近日，《表型组学（英文）》（Phenomics）在线发表了复旦大学中山医院吴俊杰副主任医师、宋元林教授、沈波教授、黎正行医师题为“Prognostic Significance of Methyl-CpG Binding Domain4 Polymorphism rs140693 and Clinical Characteristics in Chinese Lung Cancer Patients”的研究论文。该研究通过采集两家医院888名肺癌患者的血液、临床等信息，并检测相关基因多态性，利用SNPcan技术进行基因分型和采用Kaplan-Meier、多因素Cox比例风险模型分析描述了甲基-

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麻醉学其他学科医学生

2024-10-24

糖氧剥夺OGD模型有用ht22做成功的吗？细胞是什么牌子的

糖氧剥夺OGD模型有用ht22做成功的吗？细胞是什么牌子的

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临床诊断学其他学科医学生

2024-10-23

求求好友们推荐一个meta期刊，2到5分，好发的

题目是~a meta analysis and system review，心血管方向的

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已认证的机构号

2024-10-23

通过单细胞测序揭示心肌梗死后内皮细胞的异质性及其细胞命运|Medicine Advances

点击此处即可免费获取论文原文本研究通过先进的单细胞测序技术，首次全面揭示了心肌梗死后内皮细胞（ECs）的异质性和细胞命运。研究团队利用了来自成人人类心脏的单核RNA测序数据，对正常和心梗后ECs之间的动态变化和细胞间的相互作用进行了深入研究。研究发现了两个独特的EC亚群，一个是以短期间充质基因表达为特征的亚群，另一个是以长期心肌基因表达为特征的亚群。为理解心脏ECs的动态可塑性提供了新的见解，并强调了激活的内皮细胞亚群在心梗后促进炎症和组织修复中的重要作用。这一发现不仅深化了我们对心肌梗死后心脏细胞的理解，还为未来心脏疾病的治疗提供了新的方向和可能性。期刊简介Medicine Advances

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呼吸病学医学生

2024-10-23

chip 产物dna浓度疑惑

我想咨询一下，我chip做出来后检测dna浓度，input组是38.9 ng/Ul，igg组是74.2ng/Ul，ip组是26.2ng/Ul，这个结果应该不对吧，为啥igg是最高的。正常应该input组浓度最高，ip组第二，igg最少对吧。有人说洗涤没洗干净，还有什么原因导致呢？

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