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使用imageJ测量创面面积

发布于 2019-09-25 · 浏览 1.2 万 · IP 重庆重庆
这个帖子发布于 5 年零 247 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

1.使用软件打开需要测量的创面图片。

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2.在菜单栏选image-adjust-color threshold。分别调节Hue,Saturation,Brightness,使需要测量的创面被红色覆盖,中间有少许高光未选中不影响测量(具体见下文)。

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3.在工具栏选择圆形或其他形状选取工具,对要测量区域进行大致框选,有少许混杂小的斑点区域不影响测量不必纠结(具体解决见下文)。

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4.在菜单栏选analyzs-analyzs particles。size选项我们根据创面大小进行选择,下限设为1000,上限设为infinity无限,这样就可以将选区内小的杂色斑块过滤掉。circularity选0-1即可(这个选项是过滤圆度,将不圆的过滤掉)。show选outlines这样在结果输出时就会显示计量创面的轮廓。下方的选项可以将include holes先选上,这样可以过滤掉大的创面选区内未选择的高光空白。

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5.最后得到结果,total area即为创面的像素面积,结合参照marker即可计算实际面积。

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在实际操作时可以细致调节color threshold达到最理想的状态。第一次发教程,有问题大家多多交流,不足也希望大家帮我改进。


最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1.2 万

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