【专题讨论】新年2010_gift：连锁不平衡（Linkage disequilibrium）

目前随着marker检测技术发展，越来越多的突变发现！

怎么能来分析这些海量的突变？

LD的分析是目前常规方法！

SECTION 1： LD的重要性

1.首先我先介绍一下为什么要提到LD这个概念？

我们可以把marker定义为以下两种：

1）直接作用于QTL，我们可以叫做gene marker

2）有可以分为两种：

a.marker紧密联在QTL遗传到下一代，重组率发生低。我们可以称为LD marker

举个例子，A为marker；B为QTL；r2为LD(proportion of QTL variance observed at marker）
如果QTL variance为200kg2，r2为0.2 所以marker 获得variance为40kg2

b.遗传到下一代时候marker与QTL发生重组，我们可以称为LE marker.

由此可以得出，使用连锁marker（linked marker）依赖于maker与表型的关联！
换句话来说，选择MM基因型或个体来传递等位基因M,需要marker与QTL处于连锁不平衡。

--J.C.M.DEKKERS & R.L.FERNANDO

2.LD随着marker之间重组距离（recombination rate）的增加而降低。
--Ben J.Hayes
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