最新共识解读：肠道菌群移植治疗炎症性肠病的实践要点（转载自：丁香园消化时间）

肠道菌群移植（Fecal microbiota transplantation, FMT）作为炎症性肠病（Inflammatory bowel disease, IBD）的新兴治疗策略，其临床价值日益受到关注。《肠道菌群移植临床应用管理中国专家共识（2022 版）》明确了 IBD 患者中 FMT 的适应证及具体实施流程。而最新发布的《肠菌移植治疗炎症性肠病专家共识（2025 版）》进行了全面优化。本文基于 2025 版共识，系统梳理了 FMT 在 IBD 中的适应证、实施规范及未来研究方向，为临床实践提供循证依据。

新版共识更新的要点（省流版）

1. 适应症扩展： IBD 合并艰难梭菌感染仍为最明确推荐的适应证；新增对 5-氨基水杨酸治疗无效的轻中度溃疡性结肠炎患者，建议采用 FMT 作为诱导缓解手段。

2. 供体筛查强化：强调优质供体中特定益生菌（如 Ruminococcus bromii）的高丰度，并新增粪便钙卫蛋白检测，以排除隐匿性肠道炎症。同时，建议筛查并排除携带潜在毒力因子的菌株。

3. 操作策略优化：推荐采用诱导期多次输注、维持期口服胶囊方案，以增强供体菌群的定植效果。

肠道菌群与 IBD 的关系

IBD 包括溃疡性结肠炎（Ulcerative colitis，UC）和克罗恩病（Crohn’s disease，CD），其发病与肠道菌群失调密切相关。IBD 患者普遍存在菌群多样性下降，伴随促炎菌株（如Ruminococcus gnavus、Bacteroides fragilis、Escherichia coli及Clostridium innocuum）异常增殖，同时具有抗炎作用的共生菌（如Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia intestinalis、Eubacterium hallii、Eubacterium rectale及Ruminococcus bromii）显著减少。肠道菌群失调可通过直接或间接（如经短链脂肪酸、胆汁酸和色氨酸等代谢物）作用，诱发黏膜免疫紊乱，影响宿主能量代谢，并破坏黏膜屏障功能等，从而驱动 IBD 的发生与进展。FMT 作为重塑肠道微生态的有效手段，有望恢复菌群稳态、缓解炎症反应，并改善 IBD 的临床结局。

FMT 治疗 IBD 的适应症与禁忌症

 1 # 明确推荐适应证 #

IBD 合并艰难梭菌感染：IBD 患者因长期使用免疫抑制剂、抗生素或糖皮质激素，艰难梭菌感染（Clostridioides difficile infection，CDI）的风险显著升高。FMT 能迅速恢复胆酸代谢菌群，可降低 CDI 复发风险，尤其适用于 IBD 合并 CDI 的患者。研究显示，FMT 在该类患者中可实现 71% 至 94% 的治愈率。

5-氨基水杨酸治疗无效的轻中度 UC：5-氨基水杨酸制剂是治疗轻中度 UC 的一线药物，用于疾病的维持治疗和诱导缓解。对于 5-氨基水杨酸治疗反应不佳的轻中度 UC 患者，FMT 有望作为诱导缓解的补充手段。多项临床研究支持 FMT 在此类人群中的有效性。

 2 # 需谨慎评估 #

处于免疫抑制状态的 IBD 患者：近期接受高风险免疫抑制或细胞毒性治疗（如利妥昔单抗、阿霉素，或中高剂量激素 ≥ 20 mg/d 泼尼松持续 ≥ 4 周）的患者，因感染及移植相关并发症风险增加，FMT 使用需慎重评估。 

 3 # 绝对禁忌症 #

存在严重肠道并发症的 IBD 患者：如机械性肠梗阻、未经控制的肠瘘或腹腔感染、高流量腹泻、活动性脓毒血症、中毒性巨结肠、活动性消化道大出血或高度怀疑恶性病变者。

FMT 操作规范：从供体筛选到疗效优化症

 1 # 供体筛选与菌液制备 #

优质供体标准：临床有效的供体通常具备较高的菌群多样性和良好的群落结构，厚壁菌门中如 Ruminococcus bromii、Fusicatenibacter saccharivorans、Blautia wexlerae 和 Lachnospira pectinoschiza 等共生菌比例较高。

筛查与排除条件：供体需接受全面的临床评估及实验室筛查，包括粪便钙卫蛋白检测以排除隐匿性肠道炎症，同时应避免选择有 IBD 家族史供体。为降低感染风险，还应排除携带潜在毒力因子的菌株，如产毒素的 Bacteroides fragilis、Fusobacterium nucleatum 及携带 colibactin 基因的大肠杆菌。

菌液制备：菌液应在严格的厌氧环境下制备，以最大程度保留活性微生物。制备完成后应对其活菌比例、有益菌丰度及潜在病原体风险进行系统评估。

 2 # 移植途径与给药策略 #

移植途径的选择：目前 FMT 尚无统一的最佳给药途径。常用路径包括鼻胃管、鼻空肠管、胃镜或肠镜下注入、口服胶囊、保留灌肠等。现有研究显示，不同路径在诱导缓解率上差异有限，选择应结合患者个体情况与耐受性。

特殊人群管理：对于合并营养不良或高营养风险的 IBD 患者，推荐通过鼻空肠营养管实施 FMT 联合肠内营养治疗，以提升治疗效果。

多次输注与维持治疗：为提高供体菌群的定植率和微生态重建能力，FMT 可采用多次输注方案。对于获得临床缓解的患者，维持期可继续使用口服 FMT 胶囊以维持缓解。

 3 # 联合治疗与辅助策略 #

联合传统治疗：FMT 可与生物制剂、免疫抑制剂及糖皮质激素联合使用，安全性良好。其机制在于补充常规治疗难以恢复的益生菌群，从而在抗炎的基础上改善微生态环境，提升整体疗效。

抗生素预处理：对于存在艰难梭菌感染或小肠细菌过度生长（SIBO）的患者， FMT 前进行短期抗生素预处理有助于清除有害菌群，减轻黏膜炎症，促进有益菌定植，提升 FMT 的成功率与长期稳定性。

 4 # FMT 治疗后的疗效评估 #

临床评估：基于症状改善、生活质量提升及炎性指标变化，是判断疗效的基础。

内镜评估：通过内镜直观观察肠道黏膜炎症和愈合情况，评估黏膜修复程度，黏膜愈合被认为是 IBD 长期预后改善的重要标志。

微生态评估：通过高通量测序技术分析 FMT 后肠道微生物群的多样性、稳定性及关键益生菌（如 Faecalibacterium、Roseburia 等）的丰度变化，探索微生态恢复与临床缓解之间的关联，有助于揭示 FMT 机制并指导个体化治疗策略。

并发症管理

常见不良反应：由于 IBD 患者常伴肠黏膜屏障功能受损，接受 FMT 后可能出现一定比例的不良反应。轻至中度不良反应发生率约为 10%～30%，常见表现包括腹胀、排便频率增加、肠鸣音增强、排气增多及恶心反胃等，多数为一过性症状，通常在治疗后可自行缓解，无需特殊干预。

严重事件处理：应建立完善的严重不良事件监测与报告机制，覆盖 FMT 治疗期间的疾病加重、难以解释的感染或其他严重临床转归。该机制应明确责任人、上报流程与时间节点，确保及时响应和处理。若发生严重不良事件，应立即采集患者血液与粪便标本，并与供体样本进行溯源比对，以明确潜在因果关系并指导后续处置。

未来方向

 1 # 向精准 FMT 治疗迈进 #

明确供受体匹配机制：精准化 FMT 的关键在于厘清供体微生物群中具有核心作用的「功能菌」或「基石菌」——包括其菌株、亚种水平特征，以及与定植相关的生态位属性、菌间互作与交叉喂养机制等。此外，需进一步阐明受体菌群的定植拮抗机制，识别具备原籍抗性作用的菌群，并探索 FMT 前通过抗生素等手段清除关键原籍菌的策略，以提高健康菌群的定植效率。

探索预测疗效的生物标志物：未来 FMT 研究应结合多组学技术（如宏基因组、代谢组、转录组等）、生物信息学和临床数据整合，筛选并验证与疗效相关的微生物或宿主生物标志物，为供受体匹配及个体化治疗方案制定提供理论依据和工具支撑。

 2 # 研究热点拓展 #

小肠菌群干预的潜力：CD 患者小肠菌群常表现出高度促炎特征。深入探讨小肠微生态在 CD 发病与进展中的作用，并探索小肠靶向菌群干预策略，或将成为未来优化 CD 治疗的重要突破口。

功能菌群及其代谢物研究：尽管 FMT 可在一定程度上恢复菌群稳态和抑制炎症反应，但其在调节宿主免疫功能中的具体机制尚不明确。未来研究应聚焦于 FMT 过程中起核心作用的功能菌群及其代谢产物（如短链脂肪酸、胆汁酸、色氨酸衍生物），进一步揭示其免疫调节路径，从而提升治疗的靶向性与有效性。

题图 | 站酷海洛

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参考文献：

[1] 肠道菌群移植临床应用管理中国专家共识(2022版) [J].中华胃肠外科杂志, 2022, 25(09):747-756.

[2] 肠菌移植治疗炎症性肠病专家共识(2025版) [J].中华胃肠外科杂志, 2025, 28(03):225-235.

[3] Loris Riccardo, Lopetuso,Sara, Deleu,Lihi, Godny et al. The first international Rome consensus conference on gut microbiota and faecal microbiota transplantation in inflammatory bowel disease. [J] .Gut, 2023, 72: 0.

[4] Loris R, Lopetuso,Sara, Deleu,Pierluigi, Puca et al. Guidance for Fecal Microbiota Transplantation Trials in Ulcerative Colitis: The Second ROME Consensus Conference.[J] .Inflamm Bowel Dis, 2025, 0: 0.

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