mRNArchitect:使用方法
1. 打开mRNArchitect网址:https://basefacility.org.au/software/
2. 序列输入(Sequence Input)面板中允许输入一个 mRNA序列的不同部分。您可以将目标蛋白序列(核酸或氨基酸序列均可)粘贴到编码序列(Coding Sequence)空格中。
3. mRNArchitect默认使用源自人 alpha珠蛋白基因的5’和3’ UTRs。如无特殊要求,勾选Human alpha-globin前面的方框。如果需要使用源自其他基因的5’和3’ UTRs,可以将序列粘贴到空格中。您可选择加或不加Poly(A)尾,如果需要加,可在空格中粘贴序列。
4.参数(Parameters)设定面板中可以修改影响mRNA序列优化的关键变量。BASE团队推荐使用初始默认参数,但可以根据实际需要进行调整。参数解释说明将在下一篇文章中详细讨论。
5. 点击运行键(Run)开始序列设计优化。优化完成后,可以在序列输出(Output)界面看到优化的序列和相关信息,所有结果均可下载。
6. 优化的序列可以发送至第三方生产商(如IDT、GeneArt、Genescript等)进行DNA模板合成。
欢迎大家使用mRNArchitect,并反馈您的使用感受。邮件可发送到邮箱 base@uq.edu.au,中英文均可。
最后编辑于 02-10 · 浏览 281