NGS做宏基因组测序筛查微生物的报告标准
发布于 2024-11-27 · 浏览 450 · IP 上海上海
用NGS方法做样本的宏基因组，然后下机数据去做分析。
那么如果用BLAST查询的话，给出的报告，查询序列的覆盖度和一致度要在多少以上才能报告样本里面含有某种微生物（细菌或者病毒）？
还有一个问题，做生信分析的时候，是用reads去查询，还是说用reads先去拼接以后再去nt-数据库做查询？
最后编辑于 2024-11-27 · 浏览 450
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用NGS方法做样本的宏基因组，然后下机数据去做分析。
那么如果用BLAST查询的话，给出的报告，查询序列的覆盖度和一致度要在多少以上才能报告样本里面含有某种微生物（细菌或者病毒）？
还有一个问题，做生信分析的时候，是用reads去查询，还是说用reads先去拼接以后再去nt-数据库做查询？
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