测序数据做映射和比对的区别

如题，跑完宏基因组的NGS以后的下机数据，那么要去病毒数据库里面去筛，这个时候是需要先做映射（mapping）再做具体的比对（alignment）吗？

那么一般情况最基本的需要使用到的免费软件分别有那些？

例如做映射的免费软件，做比对的免费软件（这个我知道有BLAST，但是不太会用）；

还有一个问题，病毒核酸数据库哪个比较权威？（免费的）