瑞典卡罗林斯卡医学院2个博士项目
项目1
研究方向:计算发育生物学和干细胞研究
申请截止时间:2024 年8 月15 日
项目描述:
Adameyko 实验室(瑞典斯德哥尔摩卡罗琳斯卡医学院)招聘计算发育生物学和干细胞研究博士生。该博士生项目的导师是Igor Adameyko,联合导师是 Sten Linnarsson 教授(瑞典卡罗琳斯卡医学院)和 Carolina Wählby 教授(瑞典乌普萨拉大学)。
该博士项目旨在整合单细胞克隆、空间和分离细胞转录组学数据,使用机器学习方法及其他方法进行 3D 神经发育重建。单细胞和空间转录组学的结合通过将基因表达模式映射到神经组织内的特定位置,揭示细胞在其微环境中的相互作用,增加了一个关键信息层。单细胞克隆数据追踪细胞之间的谱系关系,深入了解神经细胞在发育和再生过程中的克隆进化。这种克隆数据对于识别祖细胞和了解它们在产生不同细胞类型中的作用至关重要。这些不同类型的数据集的整合可以更全面地重建神经发育过程,结合对单个细胞中发生的事情(基因表达)、发生地点(空间背景)和发生方式(谱系和克隆历史)的了解。此外,这些数据集类型(细胞状态、细胞位置和细胞谱系)的组合在神经发育障碍和神经退行性疾病建模方面特别有用,因为它可以实现胚胎和人类脑类器官中多个基于 CRISPR 的扰动实验的克隆表型分析和多路复用。在入门级别,我们期望申请者精通 Python 和 R,并了解生物学(基因组学/转录组学)。
您的申请必须包含以下文件:
- 一封个人信件和一份简历
- 学位项目和以前的出版物(如果有)
- 任何其他显示上述所需技能和个人素质的文件
- 证明您一般资格的文件
- 证明您特定资格的文件
项目2
研究方向:应激与治疗反应神经生物学
申请截止时间:2024 年8 月15 日
项目导师:Pablo Lopez
项目描述:
卡罗琳斯卡医学院神经科学系的 Lopez 实验室研究与压力相关的精神疾病及其治疗相关的分子机制、细胞回路和复杂的社会行为。正在寻找 1 名有兴趣从事该领域的博士生。该项目涉及实施压力和焦虑的动物模型,并需要分析多模态高通量分子和复杂行为数据,以解构抗抑郁治疗反应的潜在机制。
Lopez 实验室隶属于神经科学系,位于一座新的生物医学研究大楼 ( Biomedicum ) 内,提供现代化的技术平台和开放的环境,供跨部门和跨学科的互动。神经科学系由杰出的科学家组成,他们在协作和激励的环境中应用跨学科方法解决前沿问题。课题组还与生理学和药理学系 ( FyFa )、临床神经科学系 ( CNS ) 和医学生物化学与生物物理学系 ( MBB ) 密切合作,这些系在药理学、体外模型、相关临床队列和基于活动的遗传标记技术实施方面提供额外的专业知识。鼓励来自不同背景 (文化、种族、性别、性取向或社会经济) 的申请人申请。
您将获得分子生物学、功能基因组学、药理学、行为神经科学和生物信息学领域的经验。您将使用新型自动行为跟踪系统、活动依赖性标记技术和单细胞方法进行实验,以识别治疗反应期间所涉及的基因和脑回路。您需要在实验设计、实验执行、数据分析、撰写研究成果以及结果展示和发表方面发挥主导作用。如果您没有使用某种特定方法的经验,您将与合作实验室(本地和国际)合作学习和采用新技术。您还将有机会与各自领域的先驱科学家密切合作。
技能和个人素质:
申请人应拥有神经科学相关领域(生物或计算)的硕士学位,并在以下一个或多个领域拥有经验:神经生物学、分子生物学、功能基因组学、药理学、临床/转化神经科学、行为神经科学、生物信息学/计算机科学。具有与实验室动物(小鼠)打交道的经验、将 AAV 病毒立体定位注射到小鼠大脑中、熟悉动物压力/焦虑模型、具有分析行为数据(Ethovision 或 DeepLabCut)经验的候选人将优先考虑。计算技能和 MATLAB、R 或 Python 知识是加分项。申请人需要具有高度的独立性和积极性,但鉴于项目的协作性质,在团队中工作应该没有问题。流利的英语(口语和书面)是一项要求。
您的申请必须包含以下文件:
- 一封个人信件和一份简历
- 学位项目和以前的出版物(如果有)
- 任何其他显示上述所需技能和个人素质的文件
- 证明您一般资格的文件
- 证明您特定资格的文件