王炸！生信不能不会的在线分析工具—GEO2R

现今随着测序技术的蓬勃发展，测序实验也成了研究必不可少的环节。与此同时测序数据库也随着越发完善，因此学会利用数据库的数据进行生信分析能给前期研究少走许多弯路👌。

但是生信分析需要掌握的编程却一道拦路虎，今天小编给大家介绍不需要会R语言也能做简单生信分析的工具📊。接下来，就和小编一起来学习一下吧🙆！

超好用的在线生信工具：GEO2R

GEO2R是GEO 数据库中能够对表达谱芯片进行差异分析的在线工具，利用这个工具我们可以比较 GEO数据中相关数据集里的两组或多组样品，获得差异性表达基因。

📌操作步骤：

1.登录NCBI网站（ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ），选择GEO DataSets。也可以直接登录GEO数据库网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）输入想找的疾病类型，如肺癌（Lung Cancer）。

2.或者直接登录GEO数据库网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/），输入Lung Cancer后，选择第一个GEO DataSets。

3.找到与Lung Cancer相关的数据集后，选择想要的分析数据集。怎么选择能在线分析的数据集呢？

如果带有Analysis with GEO2R的字样，该数据集就能够用GEO2R进行分析。

4.点击进入GSE264186数据集后，可查看样品信息，再点击Analysis with GEO2R即可进入在线生信分析。

5.如下图可见，进入GEO2R在线分析后的界面，可以看到分组定义（Define groups），设置想要的分组，如输入Ctrl再按Enter回车键即可创建分组成功。

6.接下来再选择相应样品组，点击创建Ctrl的分组即可把选择的样品归属与Ctrl组。

7.在把样品分组定义好了后，分析前可以点击R script查看相应分析代码。

8.一切准备好了后，点击Analyze即可开始分析。

9.GEO2R快速进行基因表达谱的统计学分析的结果有火山图和韦恩图等。

如下图所示：GEO2R还列出了表达差异具有统计学意义的基因，并可以下载这些基因表格。

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