chip实验求教
我想要用chip实验验证一种转录因子对一个基因的诱导启动。先在ncbi上找了该基因的启动子序列,然后在JASPAR上找了这种转录因子的结合位点(TFBS)。现在问题来了,NCBI上的序列是编码链序列,那JASPAR上的TFBS是对应的编码链序列还是模板链序列呢?我在找该基因启动子是否存在这段TFBS时应该直接找这段序列还是它的互补序列呢?
最后编辑于 2024-04-23 · 浏览 291
我想要用chip实验验证一种转录因子对一个基因的诱导启动。先在ncbi上找了该基因的启动子序列,然后在JASPAR上找了这种转录因子的结合位点(TFBS)。现在问题来了,NCBI上的序列是编码链序列,那JASPAR上的TFBS是对应的编码链序列还是模板链序列呢?我在找该基因启动子是否存在这段TFBS时应该直接找这段序列还是它的互补序列呢?
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