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只需要输入基因与肿瘤名就可以完成几十张图的分析

烧伤外科学医学生 · 发布于 2024-02-25 · 来自 Android · IP 安徽安徽
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这个帖子发布于 1 年零 255 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

1.在疾病组中是否表达失调(高表达或低表达)

2.与患者生存是否相关(不良结局或保护)

3.探讨潜在的机制(突变、通路、肿瘤微环境)

4.耐药分析(化疗、小分子、免疫治疗)

怎么样才能发的高呢?

(1)每一步卷起来,多组学、多算法。比如表达失调,别人做mrna,你把蛋白组学也做了。比如富集分析,别人gsea用一个基因集,你用5个基因集。再比如免疫浸润,别人用cibersort,你用七种算法。

(2)点缀实验验证。越好的生信文章,越不是以生信为主体,往往是生信找到一个方向后大量实验紧随其后。

我开发了一个生信数据库,只需要输入基因和肿瘤简称就可以得到几十张可以放在正文中的figure。欢迎使用!

https://grswsci.top/analyze

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