SMARCA4变异的肺癌

肺癌患者SMARCA4变异的基因组图谱及其与预后的关系

摘要

目的：SMARCA4突变是NSCLC中最常见的反复出现的改变之一，但与其他基因组异常的关系和临床影响尚未确定。

实验设计：为了描述NSCLC中SMARCA4变异的特征，我们分析了在纪念斯隆-凯特琳癌症中心接受治疗的SMARCA4变异患者的基因组、蛋白表达和临床结果数据。

结果：在4813例NSCLC患者的肿瘤中，我们发现了8%（n=407）的SMARCA4突变肺癌患者。我们描述了两类SMARCA4突变：1类突变（截短突变、融合和纯合子缺失）和2类突变（错义突变）。蛋白质表达缺失与1类突变有关（81%对0%，P<0.001）。与SMARCA4野生型肿瘤相比，这两类突变与KRAS、STK11和KEAP1突变伴发的频率更高（P<0.001）。在转移性NSCLC患者中，SMARCA4改变与较短的总生存期有关，其中1类改变与最短的生存期有关（P<0.001）。相反，我们发现使用免疫检查点抑制剂治疗与SMARCA4突变肿瘤患者的预后改善有关（P=0.01），其中1类突变对ICIs的应答最好（P=0.027）。

结论：SMARCA4改变可分为两种临床相关的基因组类别，它们与不同的蛋白质表达以及不同的预后和治疗意义相关。这两类突变都与KEAP1、STK11和KRAS突变伴发，但各自都是不良预后的独立预测因素。尽管SMARCA4突变型肺癌与不良预后有关，但它可能对免疫治疗更敏感。