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AI辅助筛选的创新型AAV病毒变体

发布于 2024-01-05 · 浏览 719 · IP 广东广东
这个帖子发布于 1 年零 117 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

AAV病毒变体亮点抢先看


1

具备高安全性和稳定性

2

以低剂量实现高效转导

3

特异性高靶向A部位且负靶向B部位

4

增强血脑屏障、内界膜屏障穿透能力


尽管AAV病毒作为递送载体在基因治疗中已获得广泛应用,但仍存在局限性。基于AI辅助的高效筛选技术,赛业生物可以提供体外细胞或动物体内使用的创新型AAV纯化病毒,以弥补野生型AAV的不足。


以神经疾病研究为例,天然存在的AAV9血清型因血脑屏障而在脑内的转导效率受到严重限制,而传统的定向进化和理性设计产生的AAV9变体数量有限且耗时耗力。为此,赛业生物利用AI技术指导高性能和多样化序列变体的设计,在小鼠体内注射后使用NGS测序追踪结果,从而筛选出大量中枢神经系统特异性高表达的AAV9变体。


利用自主研发的AI技术和湿实验(wet lab)方法,我们能提供更为安全便捷、精准靶向目标部位的新型AAV病毒变体,其特异性和转导效率经多维度数据验证。为助力神经、眼科等疾病研究,现开放多类型AAV病毒变体的免费试用,期待更好地推动相关疾病研究及新药研发。



一、AAV9病毒变体

通过AI筛选后的AAV9病毒变体PM167、PM170在C57BL/6J小鼠模型中以较低剂量进行尾静脉注射,数据显示其对各神经相关组织的感染能力强,能高效转导中枢神经系统,同时负靶向肝脏,适用于各类神经疾病的基础和应用研究。


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二、AAV2病毒变体

通过AI筛选后的AAV2病毒变体在C57BL/6J小鼠中进行玻璃体腔注射,数据显示病毒变体对眼睛的感染能力强,适用于各类眼底疾病的基础和应用研究。


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三、AAV9病毒变体验证数据


01

高靶向中枢神经系统

赛业生物搭建的AI平台通过整合大数据、云计算、机器学习等多个技术优化AAV9衣壳蛋白,得到大量的候选变体,结果显示预测的中枢神经系统靶向性数据(图1)可信度高,PearsonR高达0.843。


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图1 中枢神经系统感染效率预测



从AI预测的序列中挑选Top序列进行单个验证,在小鼠体内尾静脉注射(5E11vg/只)后21天检测。活体成像结果显示(图2)Top序列在脑内高度富集,其中PM167脑内表达的Luc信号强度约为PHP.eB的2倍,PM170脑内表达的Luc信号强度约为PHP.eB的1.5倍。


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图2 体内验证大脑感染效率(活体成像, Luc)



为了进一步探究Top序列在中枢神经系统不同区域的分布情况,又在小鼠体内尾静脉注射(5E11vg/只)后21天检测。冰冻切片结果显示(图3)PM167在各个脑区(皮层、胼胝体、海马、中脑)以及脊髓的绿色荧光蛋白信号均显著高于PHP.eB,PM170在胼胝体以外的各个脑区以及脊髓的绿色荧光蛋白信号也均高于PHP.eB。


Cortex

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Corpus callosum

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Hippocampus

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Midbrain

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Spinal cord

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图3 体内验证大脑和脊髓感染效率(冰冻切片EGFP)



02

负靶向肝脏

赛业生物搭建的AI平台通过整合大数据、云计算、机器学习等多个技术优化AAV9衣壳蛋白,得到大量的候选变体,结果显示预测的肝脏靶向性数据(图4)可信度高,PearsonR高达0.884。


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图4 肝脏感染效率预测



从AI预测的序列中挑选Top序列进行单个验证,在小鼠体内尾静脉注射(5E11vg/只)后21天检测。活体成像结果显示(图5)PM167肝脏负靶向性显著优于PHP.eB,PM170肝脏负靶向性显著优于AAV9野生型(WT),略高于PHP.eB。


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图5 体内验证肝脏感染效率(活体成像-Luc)



在小鼠体内尾静脉注射(5E11vg/只)后21天检测,冰冻切片结果显示(图6)PM167在肝脏的绿色荧光蛋白信号显著低于PHP.eB,PM170在肝脏的绿色荧光蛋白信号略高于PHP.eB,但仍显著低于AAV9野生型(WT

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图6 体内验证肝脏感染效率(冰冻切片EGFP)


最后编辑于 2024-01-05 · 浏览 719

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