请问一些关于代谢组学的问题,请懂的前辈指教
我最近在看一些关于代谢组学的文献,刚接触质谱代谢组学这个方面,很多都不太懂,有一些疑惑,贴出来请教大家,还请懂得前辈不吝赐教,感谢。
1 文献题目 :Evidence for Chronic Kidney Disease-Mineral and Bone Disorder Associated With Metabolic Pathway Changes 2015年
Discussion 部分中“Steroid Hormone Metabolism”这二段,“vitamins including (R)-pantothenic acid 4’-O-b-D-glucoside and ascorbate 2-sulfate”。
这里我有两个疑惑。第一:我在pubchem上( https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/14132229) 查了一下(R)-pantothenic acid 4’-O-b-D-glucoside这个物质,并没有看到说这种物质是维生素呢?然后在

这一部分中点击HMDB链接,在HMDB中看到对它的描述如下

是属于一类有机化合物,称为脂肪酰糖苷的单糖和双糖。在分类中也只看到这个,那作者怎么就把它定义为维生素呢,这是如何查询的呢?

第二个疑惑: 第二种物质是ascorbate 2-sulfate,我也没查到它是维生素的说明。
2 文献题目 :Plasma metabolite biomarkers related to secondary hyperparathyroidism and parathyroid hormone 2018年
在Table 2中,作者筛选出了10种差异物质,其中Pyrimethamine(乙胺嘧啶),我查HMDB中( https://hmdb.ca/metabolites/HMDB0014350 )对此物的描述为如下:

“乙胺嘧啶只存在于使用过或服用过这种药物的人体内。它是一种叶酸拮抗剂,用于抗疟疾或与磺酰胺一起治疗弓形虫病。[PubChem]乙胺嘧啶抑制疟原虫的二氢叶酸还原酶,从而阻断嘌呤和嘧啶的生物合成,这对DNA合成和细胞增殖至关重要。这导致红细胞和肝脏分裂体形成时核分裂失败。”
这里我的疑惑是:既然它是一种药物,并非是人体本身的代谢物,为什么作者还要把它筛选为代谢差异物呢?
在此贴上这两篇文献,希望能得到前辈们的指点,谢谢。
最后编辑于 2023-04-10 · 浏览 217