R语言学习笔记

R语言学习笔记

书籍推荐《R语言编程——基于tidyverse》

# tidy：整洁的，adj。

1、R语言入门

• 软件安装
• R包加载
• 基本语句（重命名列名）
• 逻辑判断

2、数据整理

• 数据读取（文件导入和导出）
• 数据整理（提取行列、重复、行列转换、合并、for循环）

3、ggplot包

• qplot() 
• method参数

4、基本图形类型说明

5、箱型图（boxplot）

• factor() 函数（变量类型转换）
• 手动添加P值

6、生存分析（KM曲线），见帖：KM曲线

• survminer包、survival包

7、Logistic回归，见帖：Logistic回归

• pROC包
• 单条ROC曲线、多条ROC曲线
• ggroc函数
• cut-off值、AUC值
• 手动添加图例
• 多因素logistic回归，输出结果

8、多图组合

• patchwork包
• 图片存储

9、gather()函数，行列转置

10、列选择函数select()

11、theme函数，图片美化

12、labs函数（修改标题，包括图、图例、坐标轴）

13、scale函数，标尺设置（breaks, labels, limits参数）

14、subset函数，选择出符合某条件的数据或是相关的列（多条件查询）

15、排序函数

• sort()
• rank()
• order()（多重排序）

16、颜色函数

• palette()函数
• 函数rainbow()
• 函数heat.colors()、terrain.colors()、topo.colors()、cm.colors()
• colorRamp()和colorRampPalette()
• RColorBrewer包

17、绘制多条日期格式折线图

• 数据格式转化 as.numeric() as.character()

18、图例设置

• labs函数（修改图例标题）
• theme函数（删除图例、修改图例位置、修改图例方向）
• guides()函数（反转图例顺序、多个图例）