靶向，广泛靶向/拟靶向/类靶向代谢组学，非靶向的二三事

一、靶向代谢组学

靶向代谢组学是对重点关注的目标代谢物，提取其标准品的离子对和保留时间等信息。通过MRM模式采集生物样本代谢组数据，实现代谢物的绝对定性。靠谱的靶向方法需要有对应的标准品且有同位素内标校正消除检测过程中的基质效应。最后利用不同浓度梯度标准品的标准曲线，实现待测样品中代谢物的绝对定性定量。

注意：靶向绝对定量一定要满足

1 靶向方法里每一种代谢物都有和检测列表对应的标准品

2 有对应的稳定性同位素内标加在待测样本内以消除基质效应

3 定量标曲至少满足有5个不同浓度点，并且标准品需要随待测样本一起上机（前仨缺一都不是严格意义上的靶向绝对定量，缺任何一个都有可能会造成定量数据不准确）

4 现如今的靶向方法有争对一种类别的代谢物检测（如氨基酸）也有针对多种类别代谢检测的方法（如同时检测氨基酸，脂肪酸，糖类，胆汁酸类等)

二、广泛靶向/拟靶向/类靶向代谢组学

广泛靶向/拟靶/类靶向技术根据部分标准品（一般是几个内标对应测几百种代谢物）打出的质谱碎片进行提取离子，同时结合公共数据库进行代谢数据的解析，从而建立一个本地数据库；根据目标代谢物，调取本地数据库中的离子对等信息，采用MRM模式采集生物样本代谢组数据，实现对代谢物的定性和相对定量。

注意：

1 该类组学方法给的结果是相对定量，更适合做探索性研究。后期聚焦具体代谢通路或者代谢物，仍然需要做靶向绝对定量的验证。

2 套路和非靶向类似，准确性会比非靶向高一些

3 无法做数据整合

三、非靶向代谢组学

简单来说是非目标代谢组学或发现代谢组学，无偏向性地对样本中能检测到的所有代谢物进行检测分析，获得待检样本中代谢物的相对定量上的差异，通过差异化合物去研究生物学问题。

注意：可重复性差，定性需要卡各种指标，这个是人为设置的，所以提供的定性结果可信度不高