Wb经验帖‖条带数据分析之image j工具使用及条带数据的认知
一般而言,我没记错的话,wb对于ng级别的蛋白都能检测,对于蛋白测定主要是一个定性分析。什么是定性分析?什么是定量分析?学过理工科的都知道。
一:直观感受
我看到的实验室,都是跑wb都需要一种既视感----强弱明显有差别,一眼看出强弱,也就是我显影page里面的图和“若隐若现的”的描述。
二:不能直观感受
不能直观感受,以某某期刊,某某人发表的文章为例。


(以上wb的图都挺不错的,都能发了核心期刊,没有其他的意思,期刊也很不错,文章也不错,这个期刊我也发了两篇文章,所以不存在任何贬低或者歧视,如有侵权,请联系删除,以上纯属公益性学术分享内容)
这个你发现,有些图是不能直观看到差别的,这时候你需要明确的知道大概的灰度,从而进行一个对比。
关于条带对比的话,我讲讲我的见闻:
1:如果内参一致差不多情况下,就还是直接看其他功能蛋白(目的蛋白)的变化。
2:如果内参不一致,那么进行比值进行分析。

(这在我之前关于一个帖子回复里面有描述,一个同学问的,我有回复,可以去看看)
3:实验室选择的大多第一种,第二种我在一些sci上看到过,不推荐。
三:如何使用image j
(同样的,我没带电脑来医院,所以分享帖子,希望你们看看,知乎原创:

兄弟们,可以去给个关注,他做的确实不错,但是经验帖看我的没问题,让你明白的挠挠的,同样的下面的内容如有侵权等,请联系删除,纯为公益性质的分享学习)
如何使用Image J进行条带灰度分析?如Western Blot条带、酶切核酸条带等的相对定量分析。
用Image J 进行条带灰度分析的详细步骤:
第一步,首先打开软件,通File→Open 打开要分析的胶图,或直接拖拽胶图至软件即可识别;

第二步,如果胶图为黑底白带,则需要反色:点击Edit→Invert,如下图所示,变为白底黑带(用于示例的胶图质量较差,见谅)


第三步,将胶图通过Image→Type→8-bit(如下图)将图片转为8位的灰度图,即从黑到白有256(0~255)种灰色的黑白图片:

第四步,将胶图的灰色背景去掉:依次点击PROCESS→Subtract Background→ Rolling ball radius: 50.0 pixels, 勾选Light Background(去掉背景的过程从上图至下图)



第五步,用矩形选框工具(工具栏第一个)框选同一行的所有条带,如下图所示:


第六步,完成第五步的框选后,按Ctrl+1,紧接着按Ctrl+3,得到峰形图:

第七步,用如下图所示的直线工具,将所有6个小峰图封闭起来:



上图:封闭前,下图:封闭后(封闭后才可单独计算每个峰面积)
第八步,选择魔法棒工具,依次点击封闭后的各个小峰,即可得到灰度值:

