肠内容物和粪便代谢样本收集建议

粪便及肠道内容物代谢组学应用于寻找疾病生物标记物、疾病的发病机制或探究饮食和微生物代谢组之间的关系。

收集肠内容物代谢样本中很多人都有疑问，我该取哪部分肠道做分析？要解答这个问题，先来看各段内容物有什么区别：

①食物从胃进入十二指肠，大分子和蛋白降解成小分子物质，此时内容物含有较多的胆汁和胰液，游离胆汁酸在小肠近端吸收。

②进入小肠中下端氨基酸、脂肪酸等含量更加丰富，结合型胆汁酸在回肠中被主动吸收。

③ 进入大肠主要吸收水分、维生素。此段肠道菌群最丰富，维持正常内环境稳定。

④此外，有研究发现小肠防御能力较弱，而大肠防御能力最强，每段肠道的免疫功能各不相同。

所以具体选择哪段肠道内容物作代谢组学分析呢？有一下几点方法

1、可以根据疾病部位或药理机制来选择，

2、根据前期实验的结果来选择，

3、目前已发表文献大多选择盲肠和粪便样本。

肠道内容物收集方法，将动物禁食不禁水麻醉后消毒身体表面，用无菌手术刀解剖取出整个肠道，区分不同的肠段。分离内容物放入离心管，-80度保存干冰寄送。

动物粪便有多种收集方法，自然排便法是将动物放进铺有无菌滤纸的笼中， 排便后立即收集样本。比较常用的是应激排便法：将动物固定好提起尾部，用手指轻轻按压老鼠下腹部刺激排便。代谢笼收集法，更方便收集粪便和尿液，但样本容易在室温中暴露时间过长，建议采用降温措施或收集后尽快置于-80度保存。

临床人类粪便样本收集方法、采用收集器、粪便收集管和小勺混匀，尽快并分装冷冻。应格外注意：样本暴露在室温中不宜超过两小时;应在每天相同时段进行，样本收取后最好立即混匀，分管后冻存。如需同时进行16S测序等操作，样本则需要同时准备两份，避免反复冻融。