科研作图总结:ImageJ分析wb条带、油红O及免疫荧光。Graphpad prism作定量图。
一、Imagej对wb条带的灰度值分析
1.打开Imagej 程序，点击File,open 打开wb的条带图。
2.把图片转化成灰度图片，依次点击image,type，8－bit。
3.消除背景影响，点击process,选择subtract backgroud,选择50基本可以。
4.设置定量参数，点击analyze,选择set measurements,在area,mean gray value ,min max gray value ,integrate density 的括号里打√，点击Ok，Analyze,set scale,把unitof length 改成pixels.点击ok。
5.点击Edit,invert,选择一个⭕（第二个，任意一个都可），圈出第一个条带，按m键，出现Result,看IntDen的那一列。当测完所有条带，选结果中的Edit,select all,然后复制数据intden那一列的数据按照目的/内参进行计算之后，得出的数值，对照组的值取平均值，其它组的值除以对照组的平均值。后续可以利用Graphpad prisms 进行作图。
二、Imagej测油红O含量。
打开软件，然后所需的图片，点击image,adjust,color threshold,把color space 下拉选择RGB,选择select,选择analyze,set measurements,在area,mean gray value,integrated density 前面打√，点击ok。选择analyse,measure,出现result,选择intden进行结果分析。
三、Imagej 对免疫荧光图片的分析
1.打开图像后，提取出单一通道（image,color,split channels）。
2.调整阈值，选择适当的区域（image,adjust,threshold）
另外还要选择dark backgroud
3.设定需要测量的参数（analyze,set measurements）
在area,mean gray value, standard deviation,integrated density, area fraction,limit to threshold前面的方括号里打√。
4.检测（analyze,measure）。横坐标可以是分组的名称，纵坐标可以表示为Relative fluorescence intensity of XX（如mitochondria)。根据结果可以进行定量分析。
四、散点图绘制。详情见我之前的帖子。小鼠体重散点图绘制
五、散点图和柱状图叠加作图。
1.打开graphpad prism 软件，出现prism页面，点击column,data table :选择第一个（Enter or import）,其它不动，点击creat。在Data tables:Data1,从excel 表格中复制所需内容，点击graphs下的Data1,出现Graph family:column页面，选择Individual values下的第2个图，scatter plot 可选SD,点击 ok,去掉Data1,修改总纵坐标为所需的名称。（注:纵坐标如cell diameter um)底下有向左向右的箭头时才可以移动，而横坐标如control,angii 底部有类似“口”字形状时，拖动此形状才能向上，向下移动。
另外，如果想要散点为其它颜色的话，即可以先点击control组的散点，点击change下的第一行第3个（format graph）(symbols bars error bars,etc)点击symbols下的color下拉三角箭头，即可得到你想要的颜色，而且error bars 下的color 可以改变I这个颜色。
六、Photoshop把两张图片拼在一起。
1.首先打开Ps,然后点击文件，点击打开，选择要拼接的2张图片(2张一起选择)，点击虚方框□，选择其中一张图片，再按ctrl +c到另外一张图片，按ctrl+V,然后设置画布的大小，(一般大小比你两张图片的要大一些)点击图像，点击画布大小，设置高度和宽度。选择指针工具，拖动图片的位置，拼接起来，然后保存即可。
七、用PS做wb条带。
1.打开PS,点击ctrl+两个逗号加底下一点键，数条带占用的格子，从空白处格子里选中足够多的格子，选中新格子，移动到条带位置处，点击√，另存为桌面，格式为tif,命名好。
2.从wps中打开PPT演示，插图1中的图片，标好分组，如control,gapdh组，新的条带不用重复前面步骤，直接点control图片，点击更改图片，插入gapdh图片即可。
有什么不足之处恳请园友们不吝赐教！
