代谢组学生物学重复数为什么不建议是3例
1 、在代谢样本收集过程中,一个样本代表的是独立个体,造模时即使培养条件及操作手法都极其精准,每个单独的个体代谢体征还是不一样的。相较于基因组和蛋白组其动态波动大,基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易。
2、影响代谢物的改变因素是多重的,用3重复做代谢组学研究意义不大,无法有力的说明问题,因此需要很多生物学重复 来增加数据的可靠性和说服力。
3、代谢组学数据分析是基于多元统计分析方法进行的。3重复做多元统计分析时,数据模型很容易过拟合,导致数据结果假阳性偏多,会误导挖掘有效数据。
建议的重复数:通常情况下细胞/微生物样本每组至少6个生物学重复;模式动物/植物样本每组至少10个生物学重复;临床样本一般每组50个生物学重复(严格控制患者入组条件)。样本重复数越多数据结果越可靠。
















































