关于imageJ统计肌肉纤维（面积）的步骤

这段时间在分析数据，所以学习了下细胞大小（面积）的统计方法，因为原本是想要统计肌肉纤维横截面积的我，想着统计方法应该是类似的，给大家分享一下~也方便我之后再来查看。

以肌肉组织LN染色结果图参照分析（图出自文献Exosome-Mediated miR-29 Transfer Reduces Muscle Atrophy and Kidney Fibrosis in Mice）

首先，图片是以像素进行分析的，所以要先根据标尺转换成我们所需要的单位（如μm）

先打开一张图片

使用Analyze---set scale,修改unit,得到像素跟目标单位的换算，点击OK

接下来，把图片转成黑白模式（8bit即可），image----adjust----threshould,让红色区域填满感兴趣测量的区域，也要调整让边界清晰

应用之后，我们会得到一张带边界的黑白图片，使用Measure挑选区域内最大面积和最小面积，使用Analyze-analyze particles工具设置感兴趣区域的面积范围，选择outline展示结果，即可得到如下结果，对比原图，会发现有些区域重合了，那么可以返回之前的步骤，重新设置边界，即可得到纤维截面的面积，进行后续的统计分析。欢迎各位大佬提出不同方法讨论，交流~