NCBI中转录本怎么选？kegg--基因查找助力

如NCBI一般，kegg是日本的一个数据库，收录了human/mouse等很多模式生物的基因信息。kegg页面更简洁，但是功能也相对少，这也使其网页反应更快！

更重要的是你是不是经常在NCBI中大量的转录本中迷失，不知道用那个作为分子克隆的模板，看完你就知道了。

1.在浏览器输入Kegg搜索或者输入网址 https://www.kegg.jp/kegg/

2.在红色框内直接输入物种名称加基因名/ID，如hsa NRF2。也可以先点击下面的KEGG GENES，再输入基因名

3.在搜索结果框中找到你的基因名字，如红框；再点击物种明+ID，如黄框。

4.这里有给出的注释中，主要看SSDB/motif/other DBs/AA seq/NT seq

SSDB是给出不同物种的同源信息

motif是给出蛋白关键结构域

other DBs是给出该基因链接到其他数据库的通道

可以链接到ensembl去查启动子，链接到uniprot查蛋白功能注释，互作蛋白预测等等。

AA seq是该蛋白的氨基酸顺序NT seq是表达为该蛋白的CDS顺序，通常给出的是该基因经典mRNA转录本和经典蛋白剪辑体。

！！！这里有一个很重要的点就是，在NCBI查阅序列的时候没有直接给出经典序列，里面有非常多的转录本和蛋白剪辑体，你不知道用哪一个作为基因克隆的序列，可以直接用KEGG查找，这个网站给出的是经典序列。

KEGG相对来讲功能少点，但是数据库简单易懂，网页响应也相对快，联合各大数据库，熟悉运用，定能为你的科研助力！

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