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代谢组学与网络药理学

发布于 2021-12-30 · 浏览 2050 · IP 北京北京
这个帖子发布于 3 年零 131 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

代谢组学网络药理学结合聚焦关键蛋白

研讨会内容:

代谢组学研究技术与实践

1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨

代谢组学概述、操作流程、样本采集、储存及制备问题

2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性

2.1 常用技术平台介绍(NMR和LC-MS)

2.2 常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定、数据预处理与分析)

2.3 数据预处理(归一化、标准化、数据转化、缺失值评估)

3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操

3.1 样本分类(无监督和监督模式)

3.2 差异变量筛选(S-plot、S+V-plot、VIP、biplot等)

3.3 常见图形结果解读

网络药理学研究技术与实践

4、网络药理学研究思路和流程

5、网络药理学数据分析与实操

5.1 化学成分的获取与筛选

5.2 中药化学成分靶点获取

5.3 疾病靶点富集数据库

5.4 化合物与疾病靶点映射(韦恩图)

5.5 PPI网络分析(PPI网站的构建、PPI核心网络的筛选)

5.6 富集分析(DAVID数据库、Metascape 数据库)

5.7 网络图构建—Cytoscape

(数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出)

代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践

6、代谢组学与网络药理学结合研究思路

7、代谢组学与网络药理学结合分析技术

7.1 代谢组学与网络药理学数据的获取

7.2 代谢组学功能分析(富集分析、通路分析等)

7.3 小分子网络关联分析(Metscape软件、KEGG数据库等)

7.4 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析

核心技术实战

8、实例操作

8.1 TCMSP数据库获取与筛选化学成分

8.2 Swiss Target Prediction数据库预测成分靶点

8.3 DisGeNET数据库获取疾病靶点

8.4 化合物与疾病靶点映射

8.5 PPI网络绘制

8.6 DAVID软件进行富集分析

8.7 Cytoscape工具绘制成分-靶点图

8.8 Metscape绘制代谢-酶网络关联图

文献解析实例

9、代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路

9.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例(Food Res Int. 2020, 136:109503)

目标:采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联,聚焦关键蛋白。

9.2代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例(J Ethnopharmacol. 2021,264:113281. )

目标:采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联,聚焦关键通路。

9.3代谢组学和网络药理关联分析实例(Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19:1002-1013)

目标:整合代谢组学和网络药理学揭示羟基红花黄色素A抗急性脑外伤的作用机制损伤。

研讨会模式:

采用在线直播的形式、边讲边练边答疑的模式,实战跟着老师一步一步操作,过程中通过班级群实时跟踪操作结果,遇到问题及时反馈、当堂解决,让你实战不出错!


更多内容请查阅公众号:科研讨论圈

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 2050

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