dxy logo
首页丁香园病例库全部版块
搜索
登录

请问有没有前辈来看看我的课题设计合理吗?关于找差异表达的转录因子

药理学医学生 · 发布于 2021-11-10 · 来自 iOS · IP 江苏江苏
1363 浏览
这个帖子发布于 4 年零 13 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

我在鼠源肿瘤细胞中发现WT与KO的细胞中,某基因mRNA高表达,并且ActD稳定性实验发现和稳定性无关,所以我觉得和转录有关。然后我构建了该基因(又换成人源了)启动子区域的报告基因,启动子长度大约-3000。我在WT与KO的293中转染报告基因(分别转染-3000,-2000,-1000,-500),然后发现差异区域在1000-500,然后我用数据库预测这一段区域有可能有哪些转录因子,但是我比较了一下,鼠源和人源的这500bp启动子区并不是保守的,除了几个转录因子结合位点保守,很多对不上…虽然后来我找到了某一转录因子可以正调控调控该基因表达,不论是人的细胞还是鼠的细胞都可以,并且结合位点就在1000-500那个保守位点,但是我还能这样连起来吗,因为人与鼠不保守,我表型差异都是鼠细胞做的,能借助人的工具细胞研究吗?谢谢,因为课题做完了,才发现要比对启动子区域保守性,感觉这是实验设计上的超级bug啊……

11 5 1

全部讨论(0)

默认最新
avatar
11
分享帖子
share-weibo分享到微博
share-weibo分享到微信
认证
返回顶部