有效且简便的方法，教你在线预测蛋白结构！

在临床研究中，常发现基因的突变，但突变与疾病是否相关，需要大量的后续研究和结果来证明。最理想自然是通过实验手段得到突变蛋白，分析其结构和功能的改变。但在初期研究时，通过生物信息学的方法分析突变对蛋白结构改变和功能的影响，也是一种有效而且简便的方法。

目前常用的蛋白结构预测软件有PROVEAN（Protein Variation Effect Analyzer）、SIFT（Sorting Intolerant From Tolerant）和PolyPhen（Polymorphism Phenotyping）。

PROVEAN和SIFT的预测可以在同一个网址中完成，进入网址：

http://provean.jcvi.org/index.php

选择Human数据比对，点击后进入如下界面：

 在搜索栏中输入突变信息，注意突变信息的格式：“蛋白编号 突变位点 原氨基酸 突变后的氨基酸”。输入完成后点击界面下方的提交（submmit）键开始检索。结果如下：

点击View result table即可进入结果界面。

PROVEAN预测结果分为Deleterious（有害）、Neutral（中性），SIFT结果分为Damaging（有害，影响蛋白结构功能）、Tolerated（可以容忍，对蛋白结构功能无影响或影响不大）。

PolyPhen的网址为： http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/ ，在界面中输入蛋白编号，突变氨基酸位点以及突变前后的氨基酸信息，点击“Submmit Query”开始检索。

结果界面如下：

点击界面中的View，显示结果。

PolyPhen的结果有Benign（中性）、Possibly damaging和Probably damaging。其中Probably damaging有害的可能性高于Possibly damaging。

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