如果蛋白A与蛋白B存在互做，那么IP富集A是不是相当于CO-IP
发布于 2021-07-21 · 浏览 599 · IP 重庆重庆
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科研小白，求助各位大佬们。
本人目前在做环状RNA编码肽段的相关研究，目前已经证明该环状RNA可以编码肽段（称为肽段A，分子量大概在13kda），并且其末尾有一段特异性的氨基酸序列，实验室已经针对该段特异性序列定制了相应的一抗（抗A抗体）。接下来我想做一个IP富集肽段A+MS质谱检测，通过抗A抗体富集肽段A，然后跑胶分离，在13kda左右切胶打质谱鉴定出A的氨基酸序列。
目前存在的疑惑是：如果A和某蛋白（假设为蛋白B）存在互做关系的话，那我IP富集下来的蛋白是不是应该是A和B的复合物，那我做的IP实验是不是就相当于CO-IP了？如果是复合物的话，那我还是应该在13kda附近切胶吗？这样打出来的质谱还能发现A的序列吗？
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 599
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