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TCGA下载debug记录

发布于 2021-05-22 · 浏览 1976 · IP 四川四川
这个帖子发布于 3 年零 357 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

想扒TCGA数据库里面的数据碰到了一些令人窒息的困难

(1)gdc-client打不开,一直闪退

解决方法:把gdc-client.exe单独移到一个文件夹里面,比如我的路径就是D:\TOOL,然后再cmd里面输入D:\TOOL\gdc-client -h调试;

之后用控制面板-系统与安全-系统高级设置-环境变量-系统变量path 通过“浏览”添加上D:\TOOL这个路径(注意把这个路径放在最后面!不然会出问题);

然后在cmd里面直接调gdc-client就可以了

(2)txt文件一直显示[Errno 2] No such file or directory: 'gdc_manifest_test.txt'

解决方法:我首先试了一下更改文件名 (原来格式是gdc_manifest.date.txt 改成了gdc_manifest_test.txt),但是没用(也许有用吧 搞不懂);

然后,我在-m之后干脆把文件的路径加全,对我来说就是

gdc-client download -m D:\TOOL\gdc_manifest_test.txt

然后!就成了

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1976

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