TCGA下载debug记录
想扒TCGA数据库里面的数据碰到了一些令人窒息的困难
(1)gdc-client打不开,一直闪退
解决方法:把gdc-client.exe单独移到一个文件夹里面,比如我的路径就是D:\TOOL,然后再cmd里面输入D:\TOOL\gdc-client -h调试;
之后用控制面板-系统与安全-系统高级设置-环境变量-系统变量path 通过“浏览”添加上D:\TOOL这个路径(注意把这个路径放在最后面!不然会出问题);
然后在cmd里面直接调gdc-client就可以了
(2)txt文件一直显示[Errno 2] No such file or directory: 'gdc_manifest_test.txt'
解决方法:我首先试了一下更改文件名 (原来格式是gdc_manifest.date.txt 改成了gdc_manifest_test.txt),但是没用(也许有用吧 搞不懂);
然后,我在-m之后干脆把文件的路径加全,对我来说就是
gdc-client download -m D:\TOOL\gdc_manifest_test.txt
然后!就成了
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1976