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【已解决,是sds的锅】Chip不超声也是300bp小片段

发布于 2021-03-09 · 浏览 2150 · IP 新加坡新加坡
这个帖子发布于 4 年零 55 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

各位战友,最近做Chip摸索超声条件,用的新芝细胞超声破碎仪,650w总功率*7%,实际功率约45W,4s on,8s off,超声梯度为15、30、60个循环,但结果是:

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1.条带不弥散

2.对照组没有超声,直接PK消化65℃,4h的,(第二泳道)也是小片段

实验步骤:

1. 每组4*10^6个细胞,2000rpm,4min,离心收集

2.PBS 1ml重悬,加入甲醛交联(终浓度1%),室温下10min

3.125mM终浓度甘氨酸,终止交联,室温下5min

4.3000rpm,5min离心弃上清,PBS洗两次

5.500ul裂解体系:lysis buffer+蛋白酶抑制剂,冰上裂解30min,期间涡旋两次(难道是这两次涡旋导致的DNA片段化?)

6.每管取50ul出来留作对照组,余下450ul体系,每组进行相应的超声(45W,4s on,8s off,超声梯度为15、30、60个循环),冰上进行

7.超声结束后,12000rpm,10min离心,取上清

8.对照组及实验组,每组取50ul+蛋白酶K,65℃(烘箱),5h后跑胶(2%,130V,20min),每孔上样10ul。

求各位大佬救救孩子,卡了一个多月了/(ㄒoㄒ)/~~

最后编辑于 2021-04-16 · 浏览 2150

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