【已解决,是sds的锅】Chip不超声也是300bp小片段
各位战友,最近做Chip摸索超声条件,用的新芝细胞超声破碎仪,650w总功率*7%,实际功率约45W,4s on,8s off,超声梯度为15、30、60个循环,但结果是:

1.条带不弥散
2.对照组没有超声,直接PK消化65℃,4h的,(第二泳道)也是小片段
实验步骤:
1. 每组4*10^6个细胞,2000rpm,4min,离心收集
2.PBS 1ml重悬,加入甲醛交联(终浓度1%),室温下10min
3.125mM终浓度甘氨酸,终止交联,室温下5min
4.3000rpm,5min离心弃上清,PBS洗两次
5.500ul裂解体系:lysis buffer+蛋白酶抑制剂,冰上裂解30min,期间涡旋两次(难道是这两次涡旋导致的DNA片段化?)
6.每管取50ul出来留作对照组,余下450ul体系,每组进行相应的超声(45W,4s on,8s off,超声梯度为15、30、60个循环),冰上进行
7.超声结束后,12000rpm,10min离心,取上清
8.对照组及实验组,每组取50ul+蛋白酶K,65℃(烘箱),5h后跑胶(2%,130V,20min),每孔上样10ul。
求各位大佬救救孩子,卡了一个多月了/(ㄒoㄒ)/~~
最后编辑于 2021-04-16 · 浏览 2150