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慢病毒包装详细教程(包装效率提高策略、病毒浓缩、滴度测定和保存)

发布于 2020-12-04 · 浏览 2.8 万 · IP 上海上海
这个帖子发布于 4 年零 150 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
icon科研无止尽、yj1984ren 2人推荐


应小伙伴需求,来写一个慢病毒包装的详细策略,希望能帮助到正在进行这项实验的小科学家们;如有错误,希望大家积极指明,纠正错误是非常好的自我提升方式。

我将从以下六点切入,做一个较为详细的总结,大家可以根据自己的需求跳到相应的版块进行参考。需要提醒大家一点,你通过各种途径获得的实验流程不一定能完全复现,需要结合自己实验室的器材、原料、实验环境及实验人员做优化,最终使其变成适合你自己的东西。后面我会出一个非人为参数对实验结果影响的总结帖子,供大家参考。

慢病毒包装原理

慢病毒包装材料

慢病毒包装步骤

慢病毒滴度测定

慢病毒浓缩流程

慢病毒保存措施

一、 慢病毒包装原理

做实验不知道原理,出了错误就不知道如何修正。”------尼古拉斯 杰哥

我们实验室使用的3质粒系统,PxpaX2、PMD2g、以及PLVX载体的质粒。如图,各个载体载体在慢病毒包装中的作用:

img

问:为什么不将所有组分整合到1-2个质粒上?

答:慢病毒包装系统所产生的的病毒颗粒,一般不具有自主复制能力!由于单个载体在病毒产生过程中,会更容易发生基因重组,从而产生具有自主复制作用的RCV(replication competent virus,具有自主复制能力的病毒);RCV具有增殖优势,不仅会降低你目的病毒的产量,同时会产生一些安全性问题。

二、 慢病毒包装材料

1,健康的HEK 293T细胞,一般使用复苏后10代以内的细胞进行慢病毒的生产,要求无细菌、真菌以及支原体污染;

2, 转染试剂,如PEI、Higene、lipo两三千之类(哈哈哈开个玩笑,lipo2000或者lipo3000)?

各种转染试剂的步骤稍有差别,本文以PEI为转染试剂。

3,DMEM无血清无双抗培养基、DMEM完全培养基(10%FBS和1%P/S);

4, 10mL无菌注射器(环氧乙烷灭菌处理);

5, 0.45μm的细菌滤器。

三、 慢病毒包装步骤

好了,到了大家最想看的环节了,我以10cm dish体系为例。实验步骤我会精确到每一步的时间点,可以先跟着这个时间点做一次,然后根据自己的实验调整。

Day 1 (7:00 PM)

铺板HEK 293T细胞

数量:400万/10 cm dish ;觉得计数麻烦的话,可以在293T细胞长到约90%汇合时,1:5传代(均分成5份),每1份的数目差不多就是400万了。

Day 2 (3:00 PM)

三质粒转染

在培养箱中恢复细胞状态约20h,此时可进行转染。

基础知识:

三质粒的转染体系三种质粒的配比有许多种方式,我个人目前在用的为4:3:1的比例,即PxpAx2:PMD2g:PLVX(载有你基因的质粒)。

10cm dish一般转染质粒的总质量为20μg,PEI的量为质粒的2.5-3倍(也就是50μg-60μg,一般推荐按照2.5倍来)。按照比例算下来,PxpAx2:PMD2g:PLVX的质量比为:(7.5μg:2.5μg:10μg)

小贴士:在提到质粒的量时,千万记得说质量而不是浓度,不然容易出错。

实验步骤:

  1. 取如上总质量为20μg的质粒添加到总体积500μL的DMEM无血清无双抗培养基中,记为A液,移液枪混匀20次;
  2. 取PEI(一般配置成1μg/mL)50-60μg(也就是50-60μL)添加到总体积500μL的DMEM无血清无双抗培养基中,记为B液,移液枪混匀20次;
  3. 将B液逐滴滴加到A液中,移液枪轻柔混匀66次,室温静置15-20min;
  4. 将静置好的转染试剂(A+B)缓缓滴加到恢复状态20h的HEK 293T细胞中。
  5. 做好标记,记好转染时间、转染质粒、换液时间等参数提高实验重复性。

Day 3(9:00 AM)

换液

转染后的第18h,将含有转染试剂的HEK 293T上清更换为10mL DMEM完全培养基;对于新手,为了防止你在换液时将细胞吹散,可以留3mL的液体在dish中,更换8mL DMEM完全培养基。


Day 4 (3:00 PM)在转染后的48-72h,为病毒生产的高峰期,一般我们收集转染后48h(换液后30h,产毒30h)的病毒液用于实验,足以满足大部分实验需求。

收集病毒于15mL tube中,500g,5mL离心去细胞碎片和杂质,随后使用注射器和滤器进行过滤。收集后的病毒上清可以用来进行感染和储存。

四、慢病毒滴度测定

病毒滴度的单位为:TU/mL,代表每毫升病毒液中具有转导功能的病毒颗粒的数目。

计算公式为:滴度=(感染时细胞数(个)*阳性细胞%)/病毒液体积(mL)

>>>感染时的细胞数为用病毒液感染目的细胞那一时刻的细胞数,而非接种时的细胞数;

>>>具有转导功能是指该病毒颗粒具有能整合到靶细胞基因组的能力。

病毒液体积和感染时细胞数已知,需通过流式细胞术确认阳性细胞百分比。

滴度测定常常使用HEK 293T细胞,对的工具人,哦不工具细胞!

大致的原理为,将在第三部分收集到的病毒上清,按照梯度添加到293T细胞中,感染后48h检测阳性细胞的比例,从而确定病毒的滴度。

以下为我在进行滴度测定时,所整理的数据,大家可以作为参考:

img


五、慢病毒浓缩流程

慢病毒浓缩的需求常常来自于感染原代细胞,因为原代细胞通常比较难感染。浓缩可以提高病毒的滴度,也就是单位体积内病毒的个数,使用人海战术来感染目的细胞。

原理:超速离心

参数:30000g,1.5h; 离心机升速9降速3(低制动为了防止离心机在减速过程中造成颠簸扩散到伤情中,会降低浓缩效率)。

离心完成后,小心弃掉上清,加入原始病毒液1%体积的培养基或PBS重悬病毒颗粒。

六、慢病毒保存措施

对于病毒液,不论是浓缩前还是浓缩后,直接置于液氮中速冻后存于-80℃冰箱保存;-80℃保存的病毒再次融化大约损失一半的病毒颗粒;

也可以暂时存放于4℃冰箱,存放1周内,病毒滴度不会有很明显的变化。

总结

以上就是我在包装慢病毒时的经验了,里面肯定有许多不完善的地方,还请大家批评指正,一起进步哈!

对293T细胞和铺板基础感兴趣的同学,可以点击我以前的文章;

293T细胞使用经验

铺匀不同规格孔板细胞小技巧及各孔板推荐接种数目

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 2.8 万

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