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这些医学公开数据库,你们都知道吗?

发布于 2020-05-24 · 浏览 1.6 万 · IP 江苏江苏
这个帖子发布于 4 年零 347 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

大数据挖掘是现在的时代潮流,我们医学类研究现在也讲究大数据,之前很多人利用过公开的数据库来发表论文,比如GEO数据库,TCGA数据库等等,这些都属于公开的数据库。


今天主要就跟大家分享一些其他的与我们医学相关的国内外数据库:


1. 公共卫生科学数据中心

网址: http://www.phsciencedata.cn/Share/

中国公共卫生科学数据中心是中华人民共和国科技部于 2004 年启动的国家科学数据共享工程项目,全称为中国公共卫生科学数据管理与共享服务中心,由中国疾病预防控制中心承担,该项目的建设目标是集成分布在公共卫生领域、高等院校、科研院所以及科学家个人手中的公共卫生数据资源以及科研项目所产生的数据,在此基础上进行数据整合、挖掘,并通过本项目建立的网络平台向社会发布,以推动中国科学数据的共享,促进科技进步。网站将数据资源划分为传染性疾病与慢性疾病、生命登记、健康危险因素和基础信息四个分类,并增加了大量的公共卫生数据资源,包括艾滋病、甲型N1H1流感、麻疹等传染性疾病专病数据库和多次营养调查数据等

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2. 国家人口与健康科学数据共享平台

网址: http://www.ncmi.cn/

属于国家科技基础条件平台下的科学数据共享平台。2003年作为科技部科学数据共享工程重大项目立项,2010年通过科技部和财政部组织的平台认定转为运行服务,面向全社会开放提供服务。平台的总体目标是建立国家的人口与健康科学数据共享服务平台,为政府决策、人口健康、医疗卫生、人才培养、科技创新、产业发展和百姓健康提供权威、开放、便捷的数据共享和信息服务。

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3. 世界卫生组织数据库

网址: https://www.who.int/data/gho/

世卫组织的数据库囊括了世界范围的全球健康数据

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4. Open Health Data

网址: https://openhealthdata.metajnl.com/

提供各种经过同行评议的公共卫生数据信息,里面有很多已经发表的论文的原始数据。

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5. Open Access Series of Imaging Studies

网址: https://www.oasis-brains.org/

主要提供开放获取的磁共振影像数据,旨在使科学界免费使用神经影像数据集。通过编译和自由分发此多模式数据集,希望能够促进基础和临床神经科学方面的未来发现。

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6.DeepLesion

网址: https://nihcc.box.com/v/DeepLesion


DeepLesion由美国国立卫生研究院临床中心(NIHCC)的团队开发,是通过从他们自己的图片存档和通信系统中挖掘历史医学数据而开发的。这个新的数据集具有极大的潜力,将会大大促进计算机辅助检测(CADe)和计算机辅助诊断(CADx)领域的技术发展。该数据库中图像包括多种病变类型,包括肾脏病变,骨病变,肺结节和淋巴结肿大。缺乏多类别病变数据集,一直是开发能够检测多种病变类型的更通用CADe框架的主要障碍。而DeepLesion多类别病变数据集可以用来开发自动化放射诊断的CADx系统。DeepLesion数据集包含来自10,000多个病例研究的超过32,000个病变标注,现在是面向所有人可公开获得的最大的医学图像数据集。


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7. NITRC

网址: https://www.nitrc.org/

NITRC可提供有关神经信息学软件和数据。自2007年首次亮相以来,NITRC借助过去经常丢失或无视的研究软件和数据,帮助神经科学界做出了进一步发现。NITRC还提供对数据的免费访问,并允许按使用量付费的基于云的访问来获得无限的计算能力,从而以最小的启动和成本实现了全球科学合作。NITRC的内容包括:MR,PET / SPECT,CT,EEG / MEG,光学成像,临床神经成像,计算神经科学以及成像基因组学软件工具,数据和计算资源。

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8.ADNI

网址: http://adni.loni.usc.edu/

这是一个阿尔茨海默病相关的数据库。ADNI将研究人员与研究数据联合起来,共同努力确定阿尔茨海默氏病(AD)的进展。ADNI研究人员收集,验证和利用数据,包括MRI和PET图像,遗传学,认知测试,CSF和血液生物标记物作为疾病的预测因子。北美ADNI研究的研究资源和数据可通过此网站获得,其中包括阿尔茨海默氏病患者,轻度认知障碍受试者和老年人对照。

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9.OAI

网址: https://nda.nih.gov/oai

一个骨关节炎(OA)的数据库,该数据存储库提供对11年OAI纵向队列研究的数据和图像的访问 。这项研究记录了 整个疾病范围内的膝骨关节炎的自然病史,包括处于危险中的受试者,患有早期/临床前疾病,患有确定性OA的受试者以及患有晚期疾病的受试者。在OAI中,已经记录了膝OA的影像学,生化,遗传和危险标志物。将这些指标与结构和/或临床  结果进行比较可以使人们对预防和治疗这种使人衰弱的疾病有深入的了解。该OAI研究设计,措施,临床数据和DICOM图像都可以使用本网站下载。

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10.MIMIC

网址: https://mimic.physionet.org/

MIMIC 是一个重症医学数据库,全称是Medical Information Mart for Intensive Care。2003年,在NIH的资助下,来自贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)、麻省理工(MIT)、牛津大学和麻省总医院(MGH)的急诊科医生、重症科医生、计算机科学专家等共同建立的一个数据库。现在利用这个数据库发文章的人很多。

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11. DisGeNET

网址: https://www.disgenet.org/

这是一个与疾病相关的基因数据库,整合了来自各种存储库(包括孟德尔,复杂和环境疾病)的人类基因疾病协会(GDA)和变异疾病协会(VDA)的信息。

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今天就分享这11个数据库,当然还有很多其他的公共数据库,对于公共数据库大家有什么补充也可以评论留言。

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最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1.6 万

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