Quanto软件估计基因与疾病关系的所需样本量-样本量计算之五

1. 如有错误，请各位指正。
   

1.软件免费获取地址：
http://biostats.usc.edu/Quanto.html

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2.软件界面简洁

3. 实例应用比如我们向研究CYP3A5基因的rs776476位点与高血压的关系，我们查阅文献或者基因库发现该位点在亚裔人群中等位基因的频率是qA=0.23，预期OR值是1.8（此值可以适当调整，一般取1.5以上），一般人群中高血压的患病率大约为30%，则需要对照组和病例组样本量各多少人？

计算此类型样本量也需要考虑α和β的问题，我们分别取0.05和0.2，

则1，首先在Parameters-outcome/design-disease-case/control(unmatched),可以按照设计选择是匹配还是未匹配，一般是选择未匹配，在弹出来的小匡默认1即可，即未匹配的病例对照研究，同时两组样本量相等。

2.在Parameter-Hypothesis-选择Gene-only，这里我们只考虑基因，所以选择这个，若只考虑环境或者交互作用则选择基因与基因或者基因与环境交互

3.填写相关参数，选择Parameter-Gene G，弹出来的对话框填写一下参数

4. 选择Parameters-Outcome model，在弹出来的对话框中选择baseline risk，一般人群中患病率，以及基因单独的效应Genetic effect 1.8

5.然后点击Parameter-Calculate 弹出计算结果，病例组和对照各需要188例。